毛竹GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析

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【摘要】

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利用生物信息学方法,于毛竹(Phyllostachys edulis(Carr.)Lehaie)全基因组中鉴定获得18个GRF转录因子,并对其理化特性、保守结构域、系统发育关系、miR396靶位点以及基因表达

【作者】

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何龙燕刘武阳娄永峰肖复明

【机构】

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江西农业大学,江西省林业科学院,江西省信丰县林木良种场

【出处】

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植物科学学报

【发表日期】

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2018年5期

【关键词】

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毛竹 GRF 基因家族表达分析 Moso bamboo(Phyllostachys edulis) GRF Gene family Expression an

【基金项目】

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江西省青年科学基金项目(20171BAB214033)

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利用生物信息学方法,于毛竹(Phyllostachys edulis(Carr.)Lehaie)全基因组中鉴定获得18个GRF转录因子,并对其理化特性、保守结构域、系统发育关系、miR396靶位点以及基因表达模式进行了分析。结果表明,18个PeGRF蛋白长度为170~551 aa,分子量为18.5~58.8 kD;这些PeGRF蛋白均具有QLQ和WRC结构域,部分PeGRF含有FFD和TQL保守结构域。对毛竹、拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh)和水稻(Oryza sati

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