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通过对我国植物新品种保护的实施情况进行分析，发现植物新品种保护并没有发挥出预期的制度效果。本文从育种者、种子产业和管理部九三个层面探讨了影响植物新品种制度运行效率的障碍因素及其原因。提出要保证植物新品种保护充分发挥其制度效果不能把目光仅放在完善品种保护体系本身。而要从推动品种权实施、规范种子产业发展和构建品种权保护机制三个方面同时入手，并给出了相应的对策建议。