多个GEO芯片联合分析阿尔茨海默病内嗅皮层的关键基因

来源 :生命科学研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户：digitalmachineu

【摘要】

：

运用生物信息学方法筛选阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)在内嗅皮层部位的关键基因和通路,探讨AD发生发展的潜在机制。从GEO数据库下载AD的内嗅皮层芯片数据,利用R软

【作者】

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邵康梅张凡蔡宏斌魏海萍陈圆圆葛朝明

【机构】

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兰州大学第二医院神经内科,甘肃省消化系肿瘤重点实验室

【出处】

：

生命科学研究

【发表日期】

：

2021年1期

【关键词】

：

阿尔茨海默病(AD) 内嗅皮层生物信息学 Alzheimer’s disease(AD) entorhinal cortex bioinformatics

【基金项目】

：

兰州市科技计划项目(2016-3-118)

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运用生物信息学方法筛选阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)在内嗅皮层部位的关键基因和通路,探讨AD发生发展的潜在机制。从GEO数据库下载AD的内嗅皮层芯片数据,利用R软件中的sva包和limma包进行批次矫正,并筛选差异基因;运用Cytoscape软件中的ClueGO插件进行GO (Gene Ontology)与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析;使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-pr

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