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截止目前为止，建南气田发现嘉一段、飞三段、长兴组及黄龙组4个工业气层，下三叠统、二叠系、下志留统3套气源岩。通过研究不同产气层的气体组分、烷烃碳同位素系列、天然气浓缩轻烃特征认为，不同产层的天然气均为有机成因，属高温裂解气；天然气的甲乙烷碳同位素普遍存在倒转（即δ^13〉C1〉δ^13〉C2），主要是由于煤成气和油型气的不同源岩的或不同成熟度的气混合的结果；天然气藏中的混合气以腐泥型的油型气贡献以主，少量腐殖型气，而石炭系天然气成因主体属志留系烃源岩所生油的二次裂解水溶气。