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在确定水产品研究范围的基础上,利用闽台水产品出口贸易数据,比较分析1996～2010年闽台水产品出口种类结构。并结合分散度指数和结构变化指数,实证分析了闽台水产品出口产品结构的特征和变化趋势。结果表明:福建水产品出口结构逐渐趋于分散,而台湾则越来越高度集中于一类产品。在分析其发生原因的基础上,提出促进福建与台湾水产品出口并加强闽台渔业合作的政策建议。