目的采用转录组测序筛选下咽鳞状细胞癌中的miRNA的及其相关m RNA,分析明显上调和下调的miRNA,建立下咽癌的miRNA表达谱并分析其生物学功能。方法选取2014年1月至2015年12月在大连大学附属中山医院确诊为下咽癌的5例患者的癌组织和癌旁正常组织。提取总RNA并进行转录组测序。筛选在下咽癌中差异表达的miRNA,并进行功能分析。结果筛选出20个与正常组织相比在下咽癌组织中差异表达的miRNA,其中上调表达的有9个,下调表达的有11个。上调表达的miRNA的表达倍数均大于4,而上调表达最明显的是MIR2117,为7.5315倍。在下调表达的miRNA中,下调倍数大于2.0倍的有MIR101-1,MIR3671,MIR3188,MIR331,MIR3685,MIR29B1,MIR4305,MIR4265及MIR3157。其中,MIR3157下调最明显,为5.98601倍。位于这些miRNA 20 kb以内的m RNA有32个。结论筛选出在下咽癌中差异表达的miRNA,并分析了其可能调控的靶基因,为继续研究这些miRNA在下咽癌中的作用机制打下基础。