基于TCGA数据库分析肿瘤突变负荷在肌层浸润性膀胱癌预后评估中的价值

来源 :癌变.畸变.突变 | 被引量 : 0次 | 上传用户：gbcying

【摘要】

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目的:探讨肿瘤突变负荷(TMB)在肌层浸润性膀胱癌(MIBC)预后评估中的价值。方法:从TCGA数据库下载MIBC测序数据,结合临床数据分析TMB在MIBC中的临床意义,从TMB分组中识别出差

【作者】

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石海林何天基刘峰蔡孟会葛波

【机构】

：

桂林医学院附属医院泌尿外科,桂林医学院第二附属医院泌尿外科

【出处】

：

癌变.畸变.突变

【发表日期】

：

2020年6期

【关键词】

：

肌层浸润膀胱癌肿瘤突变负荷 TCGA 预后 muscle-invasivebladder cancertumor mutation burdenTCGApr

【基金项目】

：

广西省自然科学基金(2018GXNSFAA281270),广西卫生健康委员会科研课题(Z20190502)

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目的:探讨肿瘤突变负荷(TMB)在肌层浸润性膀胱癌(MIBC)预后评估中的价值。方法:从TCGA数据库下载MIBC测序数据,结合临床数据分析TMB在MIBC中的临床意义,从TMB分组中识别出差异表达的免疫相关基因进行预后分析;另外采用非负矩阵分解CIBERSORT算法确定免疫细胞与TMB亚型之间的相关性。结果:纳入的375例MIBC患者样品中单核苷酸多态性(SNP)和C>T是最常见的错义突变;TP53、TTN、KMT2D、MUC16、ARID1A基因的突变率较高;与低TMB组MIBC患者相比,高TM

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