RT-PCR和荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的检测效果分析

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【摘  要】目的:探讨RT-PCR和荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的检测效果。方法:选择我市2018年1月至2018年12月的225例手足口病患儿,均行RT-PCR和荧光探针PCR检测,对比RT-PCR和荧光探针PCR两种方法的病毒阳性检出率,包括通用型肠道病毒、EV71、CoxA16。结果:荧光探针PCR对通用型肠道病毒、EV71、CoxA16等手足口病肠道病毒的检出率明显高于RT-PCR法,差异对比显著,具有统计学意义(P<0.05)。结论:与RT-PCR相比,荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的阳性检出率较高,值得临床推广应用。

【关键词】RT-PCR;荧光探针PCR;手足口病肠道病毒;阳性检出率

【中图分类号】R446      【文献标识码】A      【文章编号】1004-7484(2019)07-0138-01
  手足口病是因肠道病毒感染引起的一种传染性疾病,多发于婴幼儿中,会引起小儿的足、手、口腔等部位发生疱疹,部分患儿甚至会引起肺水肿、心肌炎或无菌性脑膜炎等严重的并发症[1-2],其中会引起手足口病的常见病包括科萨奇病毒A组16、4、5、9、10型,肠道病毒71型(EV71)及B组的2、5型,其中最为常见的病原体类型为肠道病毒EV71型及柯萨奇病毒A组的16型[3],因此对其进行早期、准确诊断非常重要,以往多采用逆转录-聚合酶连反应(RT-PCR)周期较长,不利于快速诊断,而实时荧光定量PCR是一种新兴的用于病原体核酸快速检测的技术[4]。本文分析了RT-PCR和荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的诊断价值,以为手足口病肠道病毒检测选择合适的诊断方法,现进行如下报告。
  1 资料与方法
  1.1一般资料
  选择我市2018年1月至2018年12月的225例手足口病患儿,所有患儿的发病时间均小于7d,排除免疫性疾病、感染性疾病及其他伴发疾病等。其中男115例,女110例,年龄范围为8个月~4岁,平均年龄为3.1±0.9岁。
  1.2方法
  RNA提取试剂盒购自Roch公司,核酸分子质量标准DL2000 DNA marker购自TaKaRa公司,逆转录PCR扩增采用Titan One Tube RT-PCR Kit;荧光实时定量PCR试剂盒购自江苏硕世生物科技股份有限责任公司,实时荧光定量PCR扩增仪器为AB 公司的StepOne,琼脂糖凝胶电泳系统购自北京六一公司。
  荧光探针PCR法:取原始样本200μl,用固相提取法中的柱式提取法对RNA进行提取,并采用PCR核酸扩增检测仪进行扩增,按说明书进行温度条件、循环扩增参数设置,并设置阴性及阳性对照组。
  RT-PCR:引物序列符合《手足口病診断》标准(WS 588-2018),反应条件为50°C下进行逆转录半小时,之后94°C下2min,94°C下30s,45°C下30s,68°C下45s,进行40个循环后在68°C下7min,之后转入4°C。
  1.3观察指标
  对比RT-PCR和荧光探针PCR两种方法的病毒阳性检出率,包括通用型肠道病毒、EV71、CoxA16。
  1.4统计学方法
  采用SPSS23.0软件进行数据的处理与分析,计量资料用均数±标准差表示,计数资料用n或百分比表示,对比分析采用卡方检验,P<0.05为差异有统计学意义。
  2 结果
  表1结果表明,荧光探针PCR对通用型肠道病毒、EV71、CoxA16等手足口病肠道病毒的检出率明显高于RT-PCR法,差异对比显著,具有统计学意义(P<0.05)。
  3 讨论
  目前,手足口病检测的金标准方法是用分离、鉴定病毒的方法,常用分离方法包括乳鼠接种及细胞接种,但因细胞对病毒的敏感性导致细胞出现明显病变的周期较长,且因病毒抗原漂移容易受到阻碍,且接种乳鼠的鉴别过程繁琐耗时,因此其不适用于短时间内处理大量样本,也不满足临床早诊断及早干预的需要,且会出现难以采集合格标本的情况,从而无法对病毒进行检测,肠道病毒特异性鉴定可采用血清中和实验,多见于手足口病无症状的肠道病毒感染,但其检测方法特异性较低[5],因此需采用合适的检测方法,本文分析了荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的检测效果。
  本文结果表明,荧光探针PCR对通用型肠道病毒、EV71、CoxA16等手足口病肠道病毒的检出率明显高于RT-PCR法,差异对比显著,具有统计学意义(P<0.05),主要是由于荧光探针PCR具有快速、定量检测、灵敏度、特异度高且自动化程度高等优点[6],因此其可用于手足口病肠道病毒的检测。
  综上所述,与RT-PCR相比,荧光探针PCR对手足口病肠道病毒的阳性检出率较高,值得临床推广应用。
  参考文献
  [1]Wang M, Ren Q, Zhang Z, et al. Rapid detection of hand, foot and mouth disease enterovirus genotypes by multiplex PCR[J]. Journal of Virological Methods, 2018, 258:7-12.
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  [4]沈伟锋,邵平扬,殷新光,等.多重荧光定量RT-PCR快速甄别手足口病病原体的方法研究[J].中华临床感染病杂志,2017,10(2):141-145.
  [5]吕莉琨,杨东靖,李力,等.手足口病柯萨奇病毒A2、A4和A5型SYBRGreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立[J].中国病原生物学杂志,2017,30(1):15-19.
  [6]程洁萍,谭翰清.柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR的建立[J].热带医学杂志,2017,17(7):908-911.

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