猪圆环病毒1型贵州分离株全基因组的克隆与序列分析

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为了解猪圆环病毒(PCV)在贵州的分子流行病学和遗传变异情况,同时为其深入研究提供参考,应用PCR方法对采自贵阳、都匀和遵义地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征的病料进行PCV1全基因组的扩增、克隆和测序分析。结果表明:扩增克隆的4株PCV1基因组全长均为1 759bp,4株PCV1间的核苷酸序列相似性在99.1%~99.7%,与国内外其他PCV1参考毒株的核苷酸序列相似性均在98.1%以上,与参考毒株PCV2的核苷酸序列相似性在77%左右;4株PCV1与国内其他PCV1毒株位于同一进化分支,PCV1国外毒株则位于另一进化分支。4株PCV1和参考毒株PCV2的ORF1、ORF2推导氨基酸序列相似性分别为86.2%~87.8%和64.0%~68.2%,4株PCV1与PCV2的ORF1在复制起始区和其他功能区高度保守,可为构建嵌合病毒PCV1-2提供骨架。
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