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目的探讨胆囊结石患者胆囊内结石及黏膜微生物群落的多样性。方法选取2014年1-12月该院胆囊切除术的胆囊结石患者60例（病例组）和肝右前叶血管瘤患者11例（对照组）的胆囊黏膜样本行细菌培养,将培养结果为阴性的患者结石及黏膜进行Illumina Miseq测序分析。结果 71例患者纳入研究,对照组中样本均未检测出微生物群落DNA,病例组中微生物群落DNA提取率为94.2%。无论样本的类型,最占优势为变形细菌门。同一类型结石患者的结石和黏膜微生物群落组成比例较为一致,而不同类型的组成差异较大。结论应用Illu