采用L16(45)正交设计试验对东兴金花茶SSR-PCR反应的五因素(Mg2+,dNTPs,引物,Taq酶和模板DNA浓度)四水平进行了优化试验,然后利用优化后的反应体系,将31对同属植物SSR引物(4对茶树,7对山茶和20对金花茶引物)运用于东兴金花茶材料上,筛选适宜东兴金花茶遗传分析的SSR引物。结果表明,东兴金花茶最佳反应体系(15μL)及扩增条件为:Mg2+1.50 mmol/L、dNTP 0.30 mmol/L、引物0.40μmol/L、Taq酶0.75 U、模板DNA 40.00 ng;最佳扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,58℃退火30 s(因引物而异,该温度为引物CN10的退火温度),72℃延伸40 s,共36个循环;72℃最后延伸10 min。山茶属的不同植物之间可以共享部分SSR引物信息,东兴金花茶获得了9对能扩增出条带清晰且具有多态性的引物,引物最适退货温度为54~60℃,观测杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.433~1.000和0.391~0.932。本试验为下一步进行的东兴金花茶遗传多样性分析、遗传图谱的构建等研究奠定了基础。