【摘 要】
：
为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个
【基金项目】
：
国家自然科学基金(31172397);福建省高校新世纪优秀人才支持计划(JA14167)~~
论文部分内容阅读
为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个生物学重复)和高温处理组(3个生物学重复)分别获得15.28和13.92 Gb测序数据,GC含量平均值约为51%。过滤后的高质量测序reads使用Bowtie2软件比对到大黄鱼参考转录组序列上估计基因表达量,进而进行基因表达差异统计学检验。以常温对照组为参比,高温处理组中阈值设为|log2(FC)|>2和FDR<0.05,共检测到1 259条显著差异表达基因。其中,821条基因为高表达,438条基因为低表达。随机选取12条差异表达基因,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行了验证,结果证实转录组分析可靠。进一步将所有差异表达的基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,结果发现大量差异表达基因的功能与氧化还原反应、蛋白质折叠和去折叠、糖和脂代谢以及某些疾病的发生相关。该研究结果为下一步深入研究大黄鱼高温适应的调控机制提供了重要的参考材料。
其他文献
随着现代电子技术的迅速发展,高速电路的应用范围也在日益扩大,系统时钟频率在迅速提高。由于上升时间的加快和电路集成度的不断增加,印制电路板的线迹互连和板层特性对系统
【目的】研究应用假膜成纤维细胞构建人工关节周围骨溶解裸鼠体内模型的可行性。【方法】本实验于2006年5月至2007年1月于上海市第六人民医院中心实验室和动物实验室完成,取
在开放经济中，汇率作为核心经济变量，其调整和联系着各种宏观和微观经济因素，并且影响着各国经济的对内对外的均衡。外汇市场效率及汇率波动基本特性之研究，是外汇市场研究中基础
水是人类生活和发展的基本要素，是用途最广、需求量最大的自然资源之一。其既是工农业等一切经济活动中不可缺少、不可替代的投入资源，又是人类消费生活中不可缺少、不可替代的
<正>目的:构建大鼠OX40胞外段的原核表达载体并初步诱导表达,以期获得目的蛋白的最佳表达条件。方法:(1)取健康大鼠用ConA体内刺激一周后,心脏取血分离外周血单个核细胞,再
营销渠道作为承担向最终顾客传递价值和创造价值的相互依赖的组织的集合，在今天比以往任何时候都需要组织间的协调发展，需要动态适应多变的环境。于是，渠道成员自身、渠道成员之
翻译研究正逐渐成为一门独立学科，而其日渐丰满、成熟的理论积淀无疑受益于语言学、哲学、美学、政治学等诸多学科，表现出显著的跨学科性质。但不无遗憾的是，社科研究中广为应用
代谢工程采用基因工程技术对细胞内的代谢通量进行重新设计，该文讨论了代谢工程的发展以及三种主要的定量分析方法，并提出了需要进一步深入研究的问题及生化工作者应在代谢工程
衡阳市房地产经营集团总公司(简称“衡阳房地产集团”)是衡阳市房产局下属的事业单位，随着国有企业改制的进行和房改的深化，直管公房大量出售，同时市政府将直管公房列为国有企业
超支化聚合物是一类具有三维立体构造的高度支化的大分子。经过近15年的探索与发展,该领域在合成、功能化改性及应用研究等方面已取得了许多突破性成果,为超支化聚合物的开发