自由能计算相关论文
金属团簇催化剂在非均相催化领域有着非常广泛的应用,它们的催化性能与构型结构及电子性质息息相关。对于催化反应来说,催化体系在......
生物大分子在生命活动中有着重要的作用,它们发挥调控功能时往往伴随着复杂的构象变化,这些变化很难被常规的动力学方法捕捉到,人......
自由能是药物设计、材料设计以及生物化学过程等多个领域的研究中最核心的物理量之一。精准的自由能计算依赖于准确的哈密顿描述。......
研究生物大分子结构和功能的关系在生物和化学领域是非常重要的课题。在对蛋白质分子的研究过程中,无论是对蛋白质折叠过程分析、......
大量研究表明磷脂酰肌醇3-激酶δ(PI3Kδ)与多种恶性肿瘤及免疫疾病的发生、发展密切相关,因此成为一个备受关注的药物靶点.伊德利......
电压门控钠离子通道控制着钠离子的跨膜内流,负责启动可兴奋细胞的动作电位。它在生物的心脏节律调节和神经信号传导中发挥着重要......
沥青质是原油中一系列高分子化合物组成的混合物,具有多芳香结构、分子量大、极性强的特点,它们与各种类型的岩石矿物表面的关系密......
GLUT1是哺乳动物细胞膜上的转运蛋白,能够帮助D-葡萄糖完成沿浓度梯度的跨膜运输。转运蛋白XylE是大肠杆菌中的GLUT1同源蛋白,需要......
Gleevec(STI-571)是由Novartis公司开发的一种治疗慢性粒细胞白血病(CML)的特效药物，它作用在Abl酪氨酸激酶上，通过抑制Abl酪氨酸激......
在论文的第一部分,我们用双湮灭方法计算了谷氨酰胺结合蛋白(GInBP)单体和底物GIn结合的绝对结合自由能.模拟得到的结果是-14.59 K......
从2009年四月份以来，H1N1流感病毒的爆发引起了全世界的关注。世界卫生组织和疾病预防与控制中心一致认为奥司他韦是治疗感染流感病......
本论文在已有实验和计算研究的基础上，应用最新的分子动力学模拟和自由能计算方法对环糊精常温液态水化过程及与磷脂分子相互作用......
近几年，随着葫芦脲的合成和衍生化方法的成熟，第四代超分子主体葫芦脲已引起密切关注。葫芦脲可应用于医药、催化、分子开关和囊泡等......
The human neurodegenerative diseases and amyloidosis have aroused public attention in the past few years,and it is suppo......
神经细胞中的特定蛋白质呈淀粉样聚集会导致包括老年痴呆症,帕金森氏症以及疯牛病在内的超过20种神经性退化疾病。本文中所探讨的......
通过分子对接建立了一系列含二氟甲基磷酸基团(DFMP)或二氟甲基硫酸基团(DFMS)的抑制剂与酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B(PTP1B)的相互作用......
研究了3种由α-环糊精（α-CD）、不同线性结构及中间连接基团组成的轮烷的穿梭行为，其中，线性结构为烷基链（ALK）或聚乙二醇链（PEG），中间连接......
采用分子动力学模拟方法研究了疏水蛋白（HFBI）在亲水云母表面的吸附过程.通过6组平行的分子动力学模拟得到了2种不同的稳定吸附结构,......
以分子动力学为基础的泊松-玻尔兹曼(或广义玻恩)分子表面法(Molecular Mechanics/Poisson-Boltzmann(or Generalized Born)Surfac......
用分子动力学（MD）模拟方法优化了HIV-1病毒DNA与整合酶（IN）二聚体（IN2）复合物模型结构,并分析了HIV-1病毒DNA结合IN2后的构象变化.结果表......
目的:细胞周期素依赖性激酶(CDKS)是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的成员,能够通过调节G/S以及G2/M期而影响整个细胞周期进程。CDK2作......
含有锍离子的葡萄糖苷酶抑制剂如kotalanol（SK）和它除去磺酸基团后的衍生物（DSK），是潜在的毒副作用较小的治疗II型糖尿病的候选药物．小葡......
近年来,计算机技术发展突飞猛进,依赖于计算机技术的分子动力学模拟在物理、化学、生物以及材料研究领域都扮演着重要角色。对分子......
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轮烷是一类新兴的超分子复合物,具有多个稳定构象和一个穿梭过程,使其在制备分子器件方面有着巨大的应用价值。然而,轮烷分子体积......
自由能的计算在计算科学领域是一个非常重要的研究课题,这是由于所有的物理,化学以及生物学过程的都与反应物与产物之间的自由能差......
人血清白蛋白(human serum albumin, HSA)是药代动力学的主要考虑因素,也是研究蛋白质-配体相互作用的重要模型,因此研究药物与HSA......
通道蛋白是一类非常重要的膜蛋白。离子通过通道蛋白进出细胞，实现细胞内外的物质交换，并且完成多种生理功能。很多通道蛋白都是重要......
近年来,p-糖蛋白的研究在抗癌治疗过程中引起了广泛关注。在临床研究中发现,癌细胞具有的多药耐药性在化疗过程中会使得抗癌药物杀......
ue＊M＃’＃dkB4＃＃8＃”专利申请号:00109“7公开号:1278062申请日:00.06.23公开日:00.12.27申请人地址:（100084川C京市海淀区清华园申请人:清......
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共价小分子药物具有分子量低、亲和力高、靶点保留时间长和使用剂量小等特点,能够有效克服癌症等疾病中因靶点突变而导致的耐药性......
本文结合分子模建,分子动力学模拟方法,对G-四链体结构及其与药物小分子之间的相互作用进行了深入的研究,主要内容归纳如下:1.应用......
HIV-1病毒通过包膜糖蛋白三聚体(Envelope trimer;Env trimer)与细胞膜表面的受体和辅助受体分子发生一系列的“级联”反应进入宿......
近年来,纳米材料在生物医学领域的研究和应用获得了广泛关注。其中碳纳米管和生物大分子的组合体系为新型生物和纳米技术应用开启......
分子动力学的计算机模拟方法被越来越多得应用于生物大分子的模拟。分子力学力场为高精度的量子力学模型提供了半经验的有效的近似......
蛋白激酶CK2和PAK4都是高度保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，它们与多种细胞活动密切相关并且在多种肿瘤中过度表达，已成为多种癌症治疗......
分子动力学模拟是一种通过采用计算机模拟描述分子原子在不同时间尺度的运动的方法。其在生物化学、生物物理学方面的应用日趋广泛......
酶催化包括底物到活性区的输运、选择催化化学反应及产物释放等复杂过程，由于复杂的蛋白质环境效应，任一化学和非化学过程都有可能是......
基于钙离子结合蛋白（recoverin）在结合钙离子（Ca2+）前后构象变化的特点，运用计算机模拟设计谷胱甘肽过氧化物酶（GPx）催化中心，成功将recove......
