头颈部鳞癌PD-L1的共表达基因及调控网络分析

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目的:绘制程序性死亡受体PD-L1共表达基因关系网络,筛选潜在的PD-L1的协同标志物,寻找可能的PD-L1基因调控肿瘤免疫状态的基因和通路。方法:利用TCGA(肿瘤基因图谱数据库)中的大样本头颈部鳞癌(HNSCC)的转录组学数据,在c Bio Portal数据平台进行基因集的检索,筛选PD-L1共表达基因,在R的cluster Profiler中进行GO-BP和KEGG富集分析,再进行分子关系网络分析,提取重要节点基因(hub基因),再进行生存分析。结果:筛选出共表达基因117个,共表达基因主要富集在免疫调节和病毒反应过程。网络节度分析得到10个hub基因,依次为STAT1、IFNG、CXCL10、CCR5、FCGR3A、CXCL9、GBP5、CD86、GZMB、IRF1。生存分析显示,CCR5、CXCL9、GZMB是HNSCC预后相关的重要基因。这些基因均参与免疫过程,其表达与PD-L1相关(Pearson相关系数为0.30、0.35、0.39,P值均小于0.01)。这些基因高表达在HNSCC中均为保护因素。结论:HNSCC中的PD-L1共表达的主要基因均为免疫相关基因,其中CCR5、CXCL9、GZMB与PD-L1存在共表达关系,与预后相关,其可能与PD-1/PD-L1介导的肿瘤免疫逃避相关,为进一步研究PD-1/PD-L1的作用机制和精准靶向治疗提供了新的参考。
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