【摘 要】
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基因组的演化是一个不断发展的动态过程,基因组的结构目前仍然是生物学研究的核心问题之一.在玉米自交系中,就存在着不同自交系违反遗传共线性的现象.近期发现的Helitron
【机 构】
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Montclair State University, USA
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基因组的演化是一个不断发展的动态过程,基因组的结构目前仍然是生物学研究的核心问题之一.在玉米自交系中,就存在着不同自交系违反遗传共线性的现象.近期发现的Helitron是一类在动植物的基因组结构变化中起重要作用的转座元件,其重要特征是能够捕获赋予它们巨大演化潜力的基因序列.为了更好地研究Helitron在现代玉米基因组结构演变中所起的作用和其自身的变异,我们用自编的HelitronFinder程序对玉米基因组2.4Gb序列进行了搜索,推定出2791个非自主性Helitron,其平均长度为11.9kb.我们对其中的272个Helitron进行了更为详细的人工分析,发现它们携带来源于376个不同基因的基因片段,单一的Helitron最多可携带9个不同的基因片段.这类非自主性Helitron至少占玉米基因组的2％,并且它们中大多数在目前的自交系中均存在着有/无的多态性.总之,Helitron是一类普遍存在的真核转座元件,可能通过捕获、倍增、基因或基因片段迁移在真核基因组重塑中起到重要作用.
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