丽鲷科鱼类在进化生物学和水产养殖业中扮演着重要的角色。尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)和莫桑比克罗非鱼(Oreochromis mossambicus)不仅是研究丽鲷科鱼类进化生物学方面的有用模式生物,而且还是具有重要经济价值的养殖种类,有重要的产业前景。本研究对尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼的线粒体DNA全序列进行了测定,并应用线粒体蛋白编码基因序列分析了它们在丽鲷科鱼类中的系统进化关系。研究发现,尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼的线粒体DNA的长度分别是16,625bp和16,628bp,它们在基因顺序和结构上与其他丽鱼科鱼类的线粒体DNA一致,均包括13个蛋白编码基因、两个rRNA基因、22个tRNA基因和一个控制区。采用三种不同方法(最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)进行的系统进化分析表明,尼罗罗非鱼与莫桑比克罗非鱼关系较近,而奥利亚罗非鱼与前两者的关系较远。