【摘 要】
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The transcriptome sequencing of the salt-tolerant variety P50 and salt-sensitive variety P29 of sunflower under 120mmol/L NaC1 stress were conducted,using the illumina Hiseq 2000.10391558040nt bases w
【机 构】
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Inner Mongolia Academy of Agriculture and Animal Husbandry Sciences, Huhhot, 010031
【出 处】
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第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会
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The transcriptome sequencing of the salt-tolerant variety P50 and salt-sensitive variety P29 of sunflower under 120mmol/L NaC1 stress were conducted,using the illumina Hiseq 2000.10391558040nt bases were generated totally.In the results of De novo assembly,106275 and 119350 unigenes were received in P50 and P29,and which mean length was 716bp and 685bp,respectively.After long-sequence clustering between both samples,110751 unigenes were detected,total length for unigenes was 96970017nt,average length was 876nt,N50 was 1409nt 71610,52569,50827,46676,32215 and 52406 unigenes were severally matched to the NR,NT,Swiss-Prot,GO,KEGG and COG databases by blasting,and all of the annotated unigenes were 77536.
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