木霉菌(Trichoderma spp.)在工业、农业、环境保护等尤其在农业领域有着广泛的应用价值。国际上已有100余种木霉菌生物防治制剂或菌肥产品获得登记和商业化生产，在农业生产中发挥了重要作用。木霉菌的多样性研究对于全面揭示木霉菌生防机理和生态功能具有重要价值。因此从不同生态区域分离木霉菌资源，筛选不同特点的拮抗菌株，研究其多样性对于保护和合理利用木霉菌资源具有重要的意义。国际上共发现木霉菌89种，而我国共发现24种。在我国的华东生态区一直无人系统开展木霉菌资源调查与多样性研究。本研究从华东地区采集土壤样品287份，分离木霉菌1026株。共鉴定木霉菌13种，其中拟康宁木霉T. koningiopsis为我国新记录种，哈茨木霉为华东地区木霉种群优势种。系统研究13种木霉菌的地理分布和生物学特性多样性以及部分菌株的抗菌肽的多样性和哈茨木霉种内遗传多样性。结果表明：木霉菌普遍具有明显的生态、生化、遗传的多样性。本研究利用AFLP（amplified fragment length polymorphism）技术以及四种基因：ech42、chit33、tef1α、ITS分析了T. harzianum的种内遗传多样性，发现我国T. harzianum的种内遗传多样性是非常高的。为该种的种内异质性和其他生防方面的研究提供了数据依据。分析了不同种木霉菌间的几丁质酶和主要拮抗次生代谢物谱的差异，为建立木霉菌资源库和生物防治菌株的高效筛选奠定基础。结果表明：13种木霉间主要几丁质酶种类的酶活有着较大差异，几丁质酶活性和木霉菌的拮抗活性有着紧密的联系。木霉可产生多种拮抗类次生代谢物,其中Peptaibols类抗菌肽是木霉菌产生抑菌作用非常重要的次生代谢物。本研究通过高效液相色谱和质谱连用(HPLC/MS)对6株拮抗性较好的木霉菌进行了Peptaibols类抗菌肽检测,共检测得16种Peptaibols类抗菌肽,发现菌株间在抗菌肽种类上存在差异。为进一步研究木霉菌抗菌肽的多样性及作用机制奠定了基础。