土壤细菌等微生物群落作为生态系统的重要组成部分,对生态系统功能与过程具有重要作用。荒漠植被是我国分布面积最大的植被类型,也是我国西北地区重要的生态屏障,与其他生态系统相比,荒漠生态系统土壤细菌等微生物研究相对滞后。本文采用高通量测序手段对青海柴达木盆地和内蒙古阿拉善地区典型荒漠植被非根际土壤细菌群落结构、多样性以及与环境因子的相关性进行了系统研究。其研究成果丰富,对极端环境细菌资源库、荒漠植物生态适应、土壤状况评价以及退化生态系统修复等具有一定的理论意义与应用价值。主要研究结果如下:1)所有样品在97%相似度水平下聚类为9384个操作分类单元(OTU),已鉴定细菌归属于51门、148纲、246目、461科、1051属、729种,主要优势门包括放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)。2)各样地间α多样性指数变化范围较大,Shannon-Wiener为4.41-6.67之间,Simpson为0.005-0.032,ACE指数为1137-3820,Chao1指数范围为752-3878,多数样地的α多样性指数在灌丛冠外与冠下土样间无显著性差异。3)不同样地间细菌群落β多样性差异显著。经LefSe分析发现,除QC2(梭梭)外,其余样地在门和纲水平均有显著性差异类群,在门水平上,AZ1(四合木)酸微菌门、GS1(驼绒藜)放线菌门、QC1(梭梭)绿弯菌门、QC5(白刺)芽单胞菌门、QC8(无植被)拟杆菌门和厚壁菌门、QC9(无植被)变形菌门为显著差异类群。4)NMDS分析显示植被类型与细菌群落有一定相关性。QC7(合头藜)样地与AZ2、QC1、QC2、QC6四个梭梭样地在灌丛冠下与冠外有显著性差异,其余样地无显著性差异。5)土壤化学性质对细菌群落影响较小,冠外土样中,TC和TN对细菌群落影响相对较大,冠下土样中pH对细菌群落影响最大。