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副溶血性弧菌（Vibrio parahemolyticus）是一种重要的水产品食源性致病菌，隶属于γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria），弧菌目（Vibrionales），弧菌科（Vibrionaceae），弧菌属（Vibrio）的革兰氏阴性嗜盐细菌。它们天然存在于世界各地温暖的河口与海洋环境中，引发的食品安全事件位居微生物性食物中毒事件的首位。 本文利用高通量454焦磷酸测序技术测定了副溶血性弧菌(V. parahemolyticus) CHN25菌株的全基因组序列。经过拼接，获得了CHN25环状全基因组序列，基因组大小为5443401bp，平均GC含量45.23％，共编码4724个CDS（Coding sequence），9个16s-23s-5s rRNA操纵子，107个tRNA，以及30个假基因。CHN25基因组含有两个环状染色体，大小分别为3416467bp和1843316bp，分别编码2989个和1641个CDS；还含有三个环状质粒，大小分别为7642bp、83481bp和92495bp，分别编码30个、60个和4个CDS。序列分析发现CHN25具有6个编码转座与整合相关酶的基因，4个prophage，92个IS元件，以及1个整合接合元件。 V.parahemolyticus CHN25基因组与部分已知弧菌全基因组序列共线性比较分析发现，CHN25染色体上存在DNA序列的插入、缺失与重排。例如，CHN25一号染色体上存在一个88453bp的插入序列，编码整合接合转移相关蛋白；二号染色体上存在一个310867bp的倒置重排序列，编码ABC转运系统、精氨酸转运系统、多药外排系统、DNA接合转移调节等相关蛋白。 V.parahemolyticus CHN25基因组还含有28个耐药相关基因，其中4个基因为CHN25所独有。鞭毛相关基因分析发现，编码极性鞭毛的基因大部分位于一号染色体上，而编码侧菌毛的基因则位于二号染色体上。另外，还发现CHN25基因组不含有耐热直接溶血素基因（Thermostable Direct Hemolysin）；拥有完整的II型、III型分泌系统相关基因。此外，本文还对 CHN25的代谢途径与V.parahemolyticus RIMD2210633进行了比较分析。