随着国家西部大开发战略和科教兴新战略的积极实施，新疆高等教育事业飞速发展，高等教育管理体制改革不断深入，学校理财的宏观环境发生了较大变化，依法多渠道筹集事业资金已作为财务管理的中心任务，高等学校面向社会自主办学的新体制逐步形成。高校的财务管理已由原来的无风险管理转变为现在的风险管理。因此，有效地分析高等学校财力资源的配置情况，建立专门的指标体系和预警机制，了解内部财务运行中的问题，控制和规避高等学校财务所面临的风险，是高等学校当前财务管理的重要内容。 本文在分析财务风险含义的基础上，对高校的财务风险进行了重点分析和分类，建立了高校财务风险指标体系；选取新疆3所高校2005年决算报表数据作为分析样本，对11个风险指标进行计算与比较，运用综合评分法，综合评价了高校财务风险；结合已建立的风险评价指标，给出具体的预警界限，提出了一些控制风险的办法。为新疆高校财务风险的管理工作做出了一些有意义的探索。