20世纪90年代以来，随着信息技术和计算机制造技术的发展，模块化的方法和理念被引入到企业的生产和管理中，成为推动产业结构调整和升级的革命性力量。随着产品设计的模块化和生产过程的模块化，企业组织也出现了模块化倾向，产生了模块化组织。目前，在美、日等发达国家，模块化组织已经成为主要的生产组织方式。本文运用新制度经济学、博弈论等现代经济学的分析工具，以经济学的理论和方法为研究的理论基础，结合管理学的相关理论，深入分析模块化组织的形成及运行机理。本文以知识作为分析的主线，将模块化组织看作是一组专业化知识的联盟。通过修正的Becker-Murphy模型，研究了模块化组织的内生演化过程。进而进一步比较了模块化与分工的不同，通过建立“技术—制度—分工—组织演化”的理论模型，研究了模块化对分工演进的影响。以知识为基础的技术创新是模块化组织运作的主要内容，本文研究了模块化组织内部行为主体的耦合关系对创新激励的影响。通过研究发现：(1)模块化组织作为一种分工形态，与传统的分工具有本质上的不同。模块化组织是用来解决知识分工与任务分工矛盾的整合机制，通过组织内部密集的交流和协作来弥补分割的个人知识与整体任务间的矛盾。(2)模块化技术既是一种技术，也是一种制度，这种技术导致了不同于以往的组织之间的基于知识共享的协作方式。从技术层面，模块化技术通过促进知识增长，降低系统内部的知识关联，降低了分工所带来的协调成本；从制度层面，模块化技术作为一种协作关系的模块化操作，降低了组织内部的考核成本，提高了交易效率。模块化技术的应用使得企业的分工经济大于由此产生的交易费用，从而促进了分工的演进。(3)模块化产业中子模块供应商与整合企业的密切联系会阻碍子模块供应商的创新，但如果完全没有合作的纯市场行为也不利于模块化产业中子模块供应商的创新激励。因此，模块化产业中子模块供应商通过与整合企业组成知识联盟，以松散合作的方式进行创新是一种“双赢”的行为，增加创新行为实施后双方的收益，从而刺激了子模块供应商的创新激励，应创造相应的条件保证子模块供应商之间创新合作的持续。