2009年甲型H1N1流感是具有全球性影响力的突发性公共卫生事件，也是严重危及我国公共卫生安全的事件。这次突发性流感对中国而言具有输入性、人际传播性和国际传播性等新的特点，北京市按照既定预案全面启动突发公共卫生事件应急机制，统一了领导指挥体系，根据甲流疫情发展变化趋势，快速反应，果断决策，确立了“把紧一个关口，强化三个重点，落实四方责任”的工作格局。各部门按照“全面预防、有效控制”的原则协同作战。市政府广泛动员社会单位和广大市民、加强国际合作、信息公开透明、依法管理，在疫情初期筑起一道“外堵输入、内防扩散”的防控网络，有效遏制了甲流的传播，在疫情后期依靠科技和专家力量，加强疫苗接种和重症患者医疗救治，取得了良好的防控效果。北京市抗击甲流过程中亦暴露出甲流重症救治费用昂贵、甲流疫苗接种遭遇信任质疑的问题。今后北京市可以通过大力提倡和培育传染病“防优于治”的全民意识，建立疫苗生产应急体系，建立专项联合研发机构，建立专项突发公共卫生事件医疗救治基金等措施，进一步加强公共卫生突发事件应急管理体制建设。