自2009年开始，两岸高等教育交流实现突破，福建首次成批次派遣大学生赴台短期学习，其中，福建民办高职院校和台湾私立高职院校合作密切，两岸高校教育资源共享，既能成为台湾由于少子化所引发的高校生源危机的解决出路之一，又符合中国大陆高等教育体制改革的方向。　　本文首先从宏观的角度分析了大陆与台湾高等职业教育不同的体系与发展，两岸高等职业教育既有相似处也有不同点。同时本文指出了当前福建高等职业教育和台湾高等职业教育存在的问题，并分析了闽台两地民办高职院校合作办学的发展历程和驱动因素。闽台民办高等职业院校都遇到生存和发展的困难，共同合作为两者生存和发展打开了一个崭新的空间。其次，本文还分析了闽台民办高职院校合作办学的现状、意义及特点。目前闽台的民办高职院校合作办学主要模式以校校、校校企、分段对接及师资联合培养为主。闽台民办高职院校合作不但能服务于海西经济建设，而且将加强两岸院校、两岸师生和两岸高校科技与文化的沟通交流。在此基础上，以厦门兴才职业技术学院与台湾大华技术学院和台湾龙华科技大学的校校企联合培养人才为例，通过调查，具体研究了合作办学的模式、内涵、成效、存在问题以及未来展望，探索闽台两岸民办高职院校合作办学。　　论文最后得出以下几个结论:第一、政治因素影响闽台民办高职院校合作办学的开展与深入;第二、闽台民办高职院校合作办学项目应解决招生问题;第三、联合培养人才方案应更细致化;第四、福建民办高职院校应加强自身建设;第五、可通过多方措施解决项目经费问题。