高等院校分类是一个世界性的难题。随着中国高等教育大众化进程不断加快,中国高等院校分类价值体系缺失所带来的问题不断突出,院校之间分类不清,定位不明,发展趋同,分类管理严重缺失。大学的本质是学科组织,是体现高等院校发展水平的重要因素,从学科组织的视角对中国院校分类问题进行研究,既是一种较新的尝试,也有望针对院校分类难题形成一定突破。本论文首先从学科组织的概念出发,抽象出了“专门学院”这一学科组织的概念,并基于专门学院这一概念,假设出了院校分类的分析框架。然后在所假设的分类分析框架的基础上,从宏观层面对几个国家的高等院校类型模式进行了比较和借鉴。其次针对中国高等院校结构和学科组织的变迁特点,从专门学院的视角,提出了对中国高等院校类型模式的认识,即可将中国高校分为学科主导型、专业主导型、职业主导型三大类八小类。最后选择了上海地区60所高校为研究样本,进行了定量的类型划分,并选取了三所类型模糊的院校进行了个案分析。本论文的结论为:(1)中国高等院校发展需要形成具有中国特色的分类价值体系。(2)基于学科组织进行院校分类研究,可以将分类理论与实践进行结合。(3)立足中国国情,现阶段在发展学科型和职业型院校的同时,我国也应重视专业型院校的发展。(4)专门学院的概念适用于三类院校,发展专门学院是各类院校发展的关键所在。