本研究采用PCR方法结合毛细管电泳技术,利用14对国际通用的微卫星引物对宁乡猪个体进行扫描,根据微卫星标记的遗传多样性指标,鉴定宁乡猪间的亲缘关系。同时,采用Illumina Porcine SNP 80K芯片进行SNP分型,对宁乡猪302个个体进行全基因组扫描,探讨单核苷酸多态性对亲缘关系中个体识别的有效性。对比微卫星和SNP两种遗传标记在猪亲缘关系鉴定领域的优点和局限,优化微卫星亲子鉴定标记组合。主要研究结果如下:1.确定了SW1、SWC59、SW963、SWR1395、SW1400、SW1407、SW1417、SW1680、SW1682、SW1857、SW1918、SW2000、SW2156、SW2496等14个微卫星标记作为宁乡猪亲缘鉴定的微卫星标记组合。2.结果表明,在14个微卫星座位的267个个体中共发现172个等位基因,14个微卫星位点的平均等位基因数为12.3个,等位基因最多的是SW2496,等位基因数为20个。等位基因最少的微卫星位点为SW1682,等位基因数为6个。遗传多样性分析结果表明:除SW1和SWR1395这2个基因座在该宁乡猪群体中的遗传多态性较低外,其余12个微卫星基因座均具有高度的遗传多态性,观察杂合度为0.434~0.876,期望杂合度为0.409~0.918,多态信息含量0.388~0.912,说明可以通过检测所选14个微卫星标记进行宁乡猪亲缘鉴定。3.采用Illumina Porcine 80K SNP芯片,共检测出68528个SNP位点,根据质量控制后剩下的39469个SNP标记对302头宁乡猪进行亲缘鉴定,得到302头宁乡猪个体之间的亲缘关系,整理了现有的宁乡猪系谱资料。本论文建立的微卫星标记亲缘鉴定在动物育种领域具有一定的意义,对辅助建立健全正确完整的系谱资料,纠正潜在的错误系谱,确保我国宁乡猪现有种畜的真实身份和亲缘关系、科学引种和选配等具有一定的应用价值和实践意义。