基于微卫星标记分析黄脊竹蝗的种群遗传结构和有效种群大小

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:snake_9655
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黄脊竹蝗Ceracris kiangsu Tsai是中国特有的1种林业害虫。由于其幼虫和成虫均以竹叶为食,会导致竹林大面积死亡以及毛竹产量的下降,严重危害我国南部竹林资源,阻碍林业发展。人们已经掌握了其生物学特性,许多关于黄脊竹蝗灾害预报、防治、诱杀等各种研究也陆续展开。但迄今还没有掌握该物种足够的生态学信息,尤其是其种群结构和谱系发生信息尤为缺乏。目前,我们课题组已经以线粒体基因为分子标记对黄脊竹蝗种群结构开展了初步研究,并成功筛选出12对微卫星引物,但亟需更进一步的研究。本论文研究结果和结论如下:1.为了进一步探讨黄脊竹蝗不同地理条件下的种群遗传多样性和遗传结构,本研究采用了 10个微卫星标记对18个黄脊竹蝗地理种群进行研究。所有10个微卫星位点具有不同程度的多态性,这些多态性标记将为黄脊竹蝗种群的遗传多样性、遗传结构、基因流以及有效种群大小等研究提供一个有效的工具。各个位点等位基因数目范围为27~43,观测杂合度和期望杂合度范围分别为0.7429~0.9714和0.7193~0.9308。分析结果显示,通过Bonferroni矫正,这10个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.001),其中14个成对位点间表现为显著的连锁不平衡现象。对引物的通用性检测表明,10对引物中有7对可用于竹蝗亚科的种群遗传分析,而在蝗科中的应用却受到了一定的限制。2.基于10个微卫星位点,我们估测了我国18个地理种群共433个样本的遗传多样性和遗传分化。分析结果显示,黄脊竹蝗群体的遗传多样性非常丰富,在所有的10个位点上共扩增得到343个等位基因,平均每个位点扩增得到34.3个。群体观测杂合度为0.7099±0.0069;各种群观测杂合度范围从0.5600±0.2089到0.8543±0.0966,期望杂合度范围从0.7636±0.1033到0.9143±0.0312。所有种群杂合度的观测值低于期望值(HO<HE),表现出杂合度不足的现象。在18个地理种群中有1个种群(湖南安化,AA)的近交系数为负值(FIs<0),有17个种群存在一定近交现象(FIs>0)。STRUCTURE和FCA分析表明,黄脊竹蝗种群的遗传结构不存在明显的地理分化格局,各个地方种群之间具有混杂的共同祖先,在历史上曾有丰富的基因流;AMOVA分析结果显示92.98%种群遗传变异都发生在种群内部;瓶颈效应分析显示,大多数种群只在IAM模型下偏离突变-漂移平衡,表现出显著的杂合过剩。我们推测,在IAM模型下种群可能经历了近期瓶颈效应。3.我们使用连锁不平衡和近似贝叶斯计算法估计有效种群大小。ONeSAMP软件的结果范围在52(TY,湖南桃源)~614(GN,广东广宁)之间。LDNe软件的Ne估计值中最小值为77(TY,湖南桃源),最高值为813(GN,广东广宁)。由于遗传瓶颈的存在,有效种群大小的估计也会受到影响。较低的有效种群大小通常经历了遗传漂变和遗传多样性的降低。黄脊竹蝗种群的整体分析显示Ne值为211,暗示了种群正处于不断发展之中,我们应当实施有效的控制措施。LDNe和ONeSAMP软件评估为部分种群提供了有效种群大小信息,为了获得更多关于黄脊竹蝗种群的遗传信息,进一步的研究还需要考虑增加样本数量和环境等其他因素对该蝗种群的影响。
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