在经济转型升级的大背景下,创新愈发重要,在全球化市场竞争中逐渐成为主要优势的来源。中美贸易摩擦的时代背景之下,我国面临关键技术“断供”,新时代政府积极推动实施创新发展战略,鼓励企业、科研院所进行研发活动,在企业创新中发挥了重要作用。基于此,研究政府研发补贴政策对区域创新能力的影响,以有利于地方政府更好地落实科技创新激励政策,提升区域创新产出,增强竞争力。本文选取直接资金补贴政策与税收优惠政策作为研发补贴政策的两大典型政策。研发补贴政策通过激励效应和挤出效应对增加研发成本投入也产生推动作用,进而会影响整个区域的创新要素产出。由于激励效应和挤出效应的作用方向相反,那么研发费补贴政策对于区域科技创新转化产出增长的长远影响还难以得到确定。鉴于研发补贴与区域创新产出之间的非线性关系,本文利用面板门槛模型进行检验。但是,在什么样的区间范围内直接补贴和税收优惠对区域创新产出具有积极作用?在未来什么样的发展区间范围内政府直接提供补贴支持和各种税收政策优惠措施又都会怎样对本区域科技创新及产出增长产生何种消极负面影响作用呢?研发投入在其影响过程中发挥了多大的作用呢?同时由于各个区域的差异性,各地研发补贴政策对区域创新产出的影响又会有怎样的变异呢?哪些区域的研发补贴政策效果好,哪些区域的研发补贴政策效果差呢?又是由于什么样的原因导致这些政策效果差异呢?为回答以上问题,本文分别以区域自主创新与系统理论、市场失灵理论、技术创新与经济内生增长关系理论框架为假设基础,构建研发补贴对区域创新产出的面板门槛模型和研发投入的中介效应模型,依据市场化程度、知识产权保护力度、对外开放度3个维度将全国进行区域划分,进行异质性分析。本文以我国1998-2020年31个省份的数据为样本,运用面板门槛模型实证探究研发补贴对区域创新产出的具体影响机制以及利用sobel检验法和Bootstrap中介效应检验法对研发投入的中介效应进行分析测量。按照市场化指数将全国分成东部、中部、西部和东北地区,按照知识产权保护力度将全国分成知识产权保护力度高水平地区、知识产权保护力度中水平地区、知识产权保护力度低水平地区,按照对外开放度将全国分成对外开放度高水平地区、对外开放度中水平地区、对外开放度低水平地区,分别实证检验各地区研发补贴政策效果,为地区制定差异化研发补贴政策提供理论依据和实证证据。最后以“地区营商环境-政策环境指数”为调节变量,实证研究政策环境对研发补贴与区域创新产出之间的调节效应关系。本文主要研究结论如下:（1）随着门槛值直接补贴金额的增加,直接补贴政策对区域创新成果产出情况的总体影响系数逐渐变大。（2）随着门槛值税收优惠力度的加大,税收优惠政策因素对区域创新成果产出指标的直接影响系数可能变大。（3）随着门槛值税收优惠力度的加大,直接补贴政策对区域创新成果产出情况的总体影响系数逐渐变大。（4）研发活动经费实际投入比例和研发工作人员实际投入数量作为主要中介变量时均很显著,以研发工作人员实际投入数量作为主要中介变量而产生的中介效应远大于以研发活动经费实际投入比例作为中介变量时产生的中介效应。（5）综合对比分析东部、中部、西部和东北地区,西部地区直接补贴政策效果不显著,中部地区、东北地区的税收优惠政策效果不显著。（6）综合对比分析知识产权保护力度高水平地区、知识产权保护力度中水平地区和知识产权保护力度低水平地区,知识产权保护力度中水平地区的税收优惠政策效果不显著。（7）综合对比分析对外开放度高水平地区、对外开放度中水平地区和对外开放度低水平地区,对外开放度低水平地区直接补贴政策效果不显著。（8）政策环境对于研发补贴与区域创新产出间的调节效应显著,政策环境的改善能够强化直接补贴和税收优惠对区域创新产出的促进作用。最后提出本文的意见建议:因地制宜制定合理的直接补贴和税收优惠政策组合;营造公平公正的创新环境;加强政府研发补贴政策的绩效管理;企业加大研发投入力度。