【摘 要】
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猪的呼吸道上皮细胞拥有能同时感染人和禽两种流感病毒的受体,因此猪被看作是流感病毒的“混合容器”。一旦新型重配病毒产生,将会对人类健康造成潜在的威胁。我们的前期研究(2013-2015年)中,已经从广西多个地区分离获得了不同基因型的新型重配流感病毒(H1N1和H3N2亚型)。因此,本研究继续对广西猪场进行了持续监测,分离获得了1株H1N1和1株H3N2亚型的猪流感病毒(Swine influenza
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猪的呼吸道上皮细胞拥有能同时感染人和禽两种流感病毒的受体,因此猪被看作是流感病毒的“混合容器”。一旦新型重配病毒产生,将会对人类健康造成潜在的威胁。我们的前期研究(2013-2015年)中,已经从广西多个地区分离获得了不同基因型的新型重配流感病毒(H1N1和H3N2亚型)。因此,本研究继续对广西猪场进行了持续监测,分离获得了1株H1N1和1株H3N2亚型的猪流感病毒(Swine influenza virus,SIV),对其进行亚型鉴定,分别命名为A/Swine/Guangxi/JG24/2019(H1N1)(简称JG24株)和A/Swine/Guangxi/JG13/2019(H3N2)(简称JG13株)。通过对这两株病毒进行全基因组扩增和遗传进化分析,我们发现JG13毒株表面基因HA和NA来源于类人H3N2谱系(Human-Like,HL),而JG24毒株的表面基因HA和NA来源于欧亚类禽谱系(Eurasian Avian-like,EA)。它们的内部基因NP、M、PA、PB1和PB2均来源于2009年甲型H1N1大流感谱系(pdm09/H1N1),NS基因来源于古典型H1N1谱系(Classical H1N1Swine,CS)。有趣的是,新分离株JG13/2019的表面基因已经开始发生抗原漂移,它们与13和14年获得的H3N2毒株的HA和NA基因的核苷酸同源性仅为95.2%-95%和93.5%-93.7%。JG24/2019毒株与A/swine/Guangxi/NNLX/2014的同源性最高,HA和NA基因核苷酸同源性分别为97.5%和97.9%。将新分离毒株与近几年获得毒株进行序列分析,结果发现2个毒株均为低致病性的弱毒株,其HA蛋白裂解区域均为单一碱性氨基酸裂解位点。JG13/2019不仅保持了早期分离株结合人流感病毒SAα-2,6-Gal受体的典型位点(190D、226I和228S),而且还出现了223I和227S新位点上的氨基酸突变;NA蛋白的茎部区域均没有出现缺失,也都未在已经报道过的典型位点出现E119V/I、H274Y、R292K等的突变。与早期毒株相比,JG13/2019的内部基因出现R356K(PA蛋白)和I588T(PB2蛋白)位点的改变。此外,JG24/2019毒株的HA蛋白仍然保持为190D、225E和226Q的受体结合位点,而内部基因PB2蛋白也保持590S/591R和627E的分子特征。经过几年的遗传演变,这些氨基酸的改变是否影响到病毒的致病能力、复制能力以及跨种间传播能力,有待今后进一步的研究。
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