过去的几年来,我国主要注重工业的发展,随着工业化进程逐渐加快,工业发展已经取得了可观的成绩。在工业全面发展的同时,我国开始将目标转移到农业方面,实施工业反哺农业的政策。农产品加工业是农业的主要方面,因此现在对农产品加工业的发展和注重提高农产品加工业的科技手段已成为当下关注的核心。随着社会的不断发展,科技创新已成为一个国家竞争中的主要因素。创新是一个复杂的过程,并不是某一个主体单一的就可以完成全部工作,这就使得企业寻求合作对象,高校与科研机构掌握的先进技术和科研水平是企业所不具备的,能够弥补企业技术方面的不足,这就使得企业和高校、研究机构联合成为必然,也即当下的产学研合作。在农产品加工业方面产学研合作初见一定成果,对其分配机制、动力机制都有了一定的研究。本文主要从合作模式方面加以研究,通过研读大量国内外文献,掌握目前农产品加工业产学研合作模式现状,并从国外的成功经验中获得一定的启示。接着对吉林省农产品加工业产学研合作模式的现状和存在问题进行了阐述。基于博弈理论模型,对吉林省农产品加工业产学研合作模式进行了博弈分析,从定量角度给出产学研合作模式选择的依据。并针对吉林省农产品加工业产学研合作中存在的问题提出相关的对策建议。农产品加工业产学研合作模式的选择正确与否,是决定合作成败的关键因素,对科技创新也起到关键的作用,进而影响到一个国家的创新能力以及在国际市场的竞争力。