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第一部分肝癌差异表达基因的生物信息学分析目的:通过生物信息学方法分析HCC(Hepatocellular Carcinoma)肝癌相关差异表达基因,筛选HCC判断预后的分子标志物和免疫治疗的潜在分子靶点。方法:应用公共基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载肝癌相关芯片数据,采用JMP软件进行GSE数据集相关性分析,使用R语言中的Limma程序筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)富集分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析及蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)调控网络构建。同时联合TCGA数据库中其他肿瘤RNA-Seq转录组数据进行HCC特异性表达分析,进一步筛选HCC特异差异表达基因。结果:MBL2、SDS、SLCO1B3、TDO2、SAA4、SPP2在HCC中特异性表达下调,GPC3基因在肝癌中表达上调,只有SPP2的表达与患者的生存期正相关。结论:GPC3基因可作为HCC免疫治疗的潜在分子靶点,SPP2有望成为判断肝癌患者预后的标志物。第二部分CSMD2在肝癌中的作用初探目的:对CSMD2基因进行系统进化分析和功能注释,检测其在HCC组织和癌旁组织中的表达,并探讨CSMD2在HCC中的作用。方法:通过NCBI数据库检索CSMD2序列,采用Tree Fam网站构建CSMD2系统进化树,对CSMD2进行功能注释,q RT-PCR技术及免疫组化方法分别检测CSMD2在HCC组织的表达,分析CSMD2在不同临床病理特征HCC病人的表达情况。结果:在RNA水平上,CSMD2在癌旁组织中的表达高。免疫组化方法检测,CSMD2在癌旁组织中阳性表达率为52.0%,在HCC组织的阳性表达率为84.0%。CSMD2在肝癌组织内的表达与患者的性别、年龄、术前AFP、巴塞罗那分期、病理分级、HBs Ag阳性与否,肿瘤的大小及数目等无相关性,CSMD2在HCC患者的表达缺失与患者的淋巴结转移正相关(p<0.05)。结论:CSMD2的表达缺失可能导致HCC的转移。