目前，在我国注册会计师审计市场上，存在着比较严重的“低价揽客”或购买审计意见的现象。不同地区、不同事务所对不同企业存在着差异收费的情况。这些在审计费用收取方面的问题严重制约了独立审计服务市场的发展，引起了理论界和实务界的重视，并且已经和正在进行着较为广泛的研究。同时，现代企业因两权分离带来的委托代理问题，导致了企业内部信息不对称，委托人和受托人目标往往不一致。独立的审计活动更加必不可少。以往的研究成果显示，影响审计收费的因素众多，诸如企业规模、公司业务复杂程度、事务所规模等。本文以制造业上市公司为例，选择公司治理结构的角度对审计费用的影响进行研究。文章首先总结分析了以往学者有关审计费用影响因素的研究成果，并从中找到了研究方向。然后将公司治理结构按照其特征和组成分为：股权结构、董事会结构和管理层结构三部分。又将每一部分进一步的细分为股权集中度、股权性质、董事会独立性、是否设立审计委员会和管理层的激励机制，分别研究其对审计费用的影响。本文采用理论分析和实证研究相结合的方法，以公司治理理论、公司治理特征、审计费用理论和审计风险理论为基础，提出了假设并进行了实证研究。文章采用上市公司中，占据较大比例、具有代表性的制造业2012年深沪两市的数据作为研究样本，利用统计学软件Excel和Stata对数据进行加工和多元回归分析。结果显示制造业在公司治理结构对审计费用影响情况上，与以往学者对整个上市公司的研究结果有所区别。这说明了，不同行业在公司治理对审计费用的影响机制上存在着差别，应当分别进行研究分析，为今后研究审计费用开辟了一个新的方向。并且为相关部门，按行业细分审计费用的收费标准，提供了依据和参考。也为进一步完善公司治理结构提供了借鉴。