1.对香溪河流域和洱海流域底栖藻类组成进行研究。K-S检验表明两流域水体理化因子和不同尺度土地利用差异显著。洱海流域发现的物种数远多于香溪河流域。研究发现两个流域底栖藻类优势种具有相似性。Achnanthesdeflexa、线形曲壳藻(Achnantheslinearis)、极细微曲壳藻(Achnanthesminutissima)、扁圆卵形藻(Cocconeisplacentula)和席藻(Phormidiumsp.)为两流域常见的优势物种，但香溪河流域以线形曲壳藻为绝对优势种，而洱海流域以极细微曲壳藻为绝对优势种。Indval分析表明虽然两流域具有相似的优势种，但很多非优势种具有显著差异。　　 2.不同尺度土地利用格局对河流生态系统的影响是河流生态学家一直关注的问题。已经有大量研究表明不同尺度土地利用格局对鱼类和大型底栖动物空间分布的影响，而对于底栖藻类研究相对较少。TDI是底栖藻类用于河流健康评价的重要参数。物种丰富度是生物群落多样性的重要表征。研究结果显示香溪河流域TDI和物种丰富度与农田百分比和森林百分比均没有显著相关性，这可能是由于香溪河土地利用并没有明显梯度。而洱海流域TDI和物种丰富度与农田百分比和森林百分比均有显著相关性。在洱海流域TDI和物种丰富度表现出与河段尺度土地利用关系更为密切。结果说明河段尺度的土地利用对河流底栖藻类群落的影响更大。　　 3.许多研究表明大尺度环境因子能直接或者间接的影响小尺度的环境因子。在不同空间尺度下群落特征参数会受到不同尺度环境因子的影响。研究的结果表明可能是由于香溪河流域大尺度环境因子相对的同质，造成TDI和物种丰富度差异主要是小尺度的环境因子。而洱海流域大尺度的环境因子对TDI和物种丰富度的影响相对更重要。两流域间TDI主要受到Alititude和农田百分比的影响，物种丰富度主要受到Alititude和森林百分比的影响。而农田百分比和森林百分比呈显著的负相关，所以可以认为影响两流域TDI和物种丰富度差异的因素相同。　　 4.群落组成一直是群落生态学家们广泛研究的问题。一定空间尺度下的环境因子的空间差异能导致底栖藻类组成空间上的差异。而这归根结底都可以看做是群落的趋同性和趋异性问题。pCCA结果表明大尺度的环境是影响香溪河流域、洱海流域以及流域间底栖藻类空间分布的主要的环境因子。对各流域和流域间进行趋同性研究。结果发现香溪河亚流域相似性差异不显著，但古夫河底栖藻类表现出较高的趋同性。洱海流域亚流域间组内相似性高于组间相似性，说明底栖藻类在不同亚流域间有趋异性，而在亚流域内具有趋同性。虽然十八溪样点趋同性不强，因为流域内具有较大的海拔差异。MSA分析表明流域间组内相似性高于组间相似性，说明底栖藻类在不同流域间有趋异性，而在流域内具有趋同性。对不同农田百分比的分组的MSA分析发现香溪河流域各组的没有显著性差异，说明该流域表明不同的土地利用格局间底栖藻类并不趋同。洱海流域不同农田百分比组间差异显著。流域间的MSA分析也表明不同土地利用组的组内相似性明显高于组间相似性，说明底栖藻类在不同土地利用组间具有趋异性，组内具有趋同性。而研究发现即便三个组内都具有趋同性，但是较高的土地利用组中趋同性更强，所以可以推断土地利用的影响使得底栖藻类的β多样性降低。　　 5.底栖藻类群落的趋同性和趋异性表明在认为的环境条件下，其群落具有趋同性。在不同空间尺度下群落的趋同性是相对的。非生物环境因子和扩散是形成群落空间分布的两个主要因素。而这两者对于不同时空尺度的群落组成的重要性各有不同。本章对洱海流域和香溪河流域以及这两个流域间的环境因子和空间因子对底栖藻类的贡献进行了一系列研究。结果表明在流域间，空间因子对底栖藻类的贡献相对较小，而在流域尺度空间因子的贡献明显高于流域间尺度。说明在较大的空间尺度下藻类的扩散能力受到环境异质性的限制。但这并不绝对。在流域尺度较大的环境异质性同样限制了藻类的扩散能力。如洱海流域春季由于较大的土地利用和海拔差异，空间因子的解释率只有总解释率的10.57％。而在冬季样点间环境差异小，空间因子的解释率到达了总解释率的44.57％。该结果证明任何空间尺度下环境的差异性是影响藻类空间分布主要原因，在相似的环境条件下扩散使得该地区底栖藻类组成趋同。