食管癌肿瘤浸润免疫细胞预后相关性的meta分析及生物信息学分析

来源 :北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:MSYANXU
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背景与目的近年来,人们一直在寻找可以预测食管癌患者预后的标志物。目前已有不少研究报道了肿瘤浸润免疫细胞的预后价值,但此类研究几乎都存在不够深入和系统的问题。本研究的目的在于运用meta分析和生物信息学方法评估食管癌组织中浸润的不同亚群免疫细胞的预后相关性。研究方法通过检索 Pubmed,Embase,Cochrane Librarγ 和 Web of Science 这 4 个数据库筛选食管癌肿瘤浸润淋巴细胞预后意义相关研究。根据免疫细胞亚群和其浸润部位对数据进行分组整合,计算HR和95%CI以评估不同亚群免疫细胞的预后相关性。下载TCGA数据库中食管鳞癌和腺癌患者的RNA测序数据及临床数据。通过单样本基因富集分析,利用其它文献报道的不同亚群免疫细胞的标签基因组,计算每个食管癌患者肿瘤组织中的每种免疫细胞的富集指数作为对该种细胞数量的估计值。结合患者生存信息评估每种免疫细胞的预后相关性。评估全部免疫细胞标签基因的预后相关性,通过COX比例风险模型构建最优预后预测模型。研究结果共筛选出29篇评估食管癌患者肿瘤浸润淋巴细胞预后价值的已发表文章。meta分析结果显示,癌巢(TN)和肿瘤间质(TS)部位的高水平总肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)与良好的总生存率(OS)相关(HR = 0.54,95%CI0.44-0.65,p =0.00001);癌巢部位,肿瘤间质部位以及癌巢和肿瘤间质部位的高水平CD8+T细胞与良好0S相关(HR = 0.77,95%CI 0.66-0.89,p = 0.0005;HR = 0.67,95%CI0.57-0.79,p = 0.00001;HR = 0.76,95%CI 0.63-0.91,p = 0.004)。食管鳞癌中,激活B细胞、激活CD8T细胞、CD56dimNK细胞、嗜酸性粒细胞、效应型CD8+记忆T细胞、γδT细胞、巨噬细胞、肥大细胞、NK细胞及类浆细胞型树突状态细胞的ES值与患者OS相关;食管腺癌中,中央型CD8+记忆T细胞与滤泡型辅助T细胞ES值与患者OS相关。基于肿瘤浸润免疫细胞,预后相关免疫标签基因和临床指标可以构建更好的预后预测模型。结论总肿瘤浸润淋巴细胞及CD8+T细胞是潜在的食管癌患者预后标志物。多种亚群的免疫细胞与食管鳞癌及腺癌患者的预后相关。联合运用肿瘤浸润免疫细胞、预后相关基因和临床指标可构建更好的患者预后预测模型。
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