RgsA在铜绿假单胞菌抗氧化应激中的作用

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:abcdef13333
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:铜绿假单胞菌是临床上极为常见的条件致病菌,患代谢性疾病、血液病和恶性肿瘤的患者,以及术后或某些治疗后的患者易感染本菌,具有多重耐药的特点。寻找铜绿假单胞菌通过何种途径感知外界的变化,以何种方式改变生理学过程从而适应环境,一直是该菌的研究热点之一。细菌小RNA(small regulatory RNA)是细菌中普遍存在的一类长度在40~500个核苷酸的,具有调控功能的小分子RNA,简称为sRNA(small RNA),sRNA在广泛细菌种群的许多关键生命进程中发挥重要的调控作用,其调控作用在数量上和多样性上甚至超过了蛋白质。迄今已在铜绿假单胞菌中发现29种sRNA,其中RgsA是由Nicolas González在2008年进行全基因组搜索发现的,存在于铜绿假单胞菌和荧光假单胞菌中的sRNA,推测可能与铜绿假单胞菌抗氧化应激反应有关,在铜绿假单胞菌生物膜状态下高度表达。铜绿假单胞菌难治性持续性感染与生物膜形成联系密切。在人类感染性疾病中,约有65%与生物膜有关,例如牙菌斑、囊性纤维化肺病、反复发作的慢性中耳炎、慢性骨髓炎、慢性鼻窦炎及慢性伤口感染等。对本研究拟从sRNA RgsA的基本结构、功能、作用机制到调控方式进行深入研究,以探讨该sRNA在铜绿假单胞菌生命活动中的作用。方法:(1)本研究以铜绿假单胞菌PAO1菌株作为实验菌株,根据公用数据库的序列信息和文献资料设计合成引物,采用5′RACE确定转录起始位点,结合Northern blot与计算机预测3′末端转录终止序列,以确定RgsA的基本转录本结构。(2)在此基础上,PCR扩增rgsA同源臂与庆大霉素抗性基因插入自杀质粒pEX18-Ap,构建rgsA基因敲除载体,利用双亲杂交转化铜绿假单胞菌PAO1,构建rgsA基因缺陷株SH2-5。(3) PCR扩增rgsA基因编码片段,插入pJN105质粒阿拉伯糖诱导型启动子的下游,构建rgsA基因表达载体,转化rgsA基因缺失缺陷株SH2-5,构建rgsA基因补偿/过表达株。(3)以生长时间为横坐标,OD600值为纵坐标绘制生长曲线,观察野生株、rgsA基因缺陷株的生长情况。(4)利用Trizol法分别抽提不同浓度过氧化氢,有机过氧化物刺激下铜绿假单胞菌的总RNA,Real-time PCR检测RgsA表达情况。(5)以含有不同浓度过氧化氢,有机过氧化物LB平板作为培养基进行平板实验,以不同浓度过氧化氢与不同反应时间组合,进行MTT实验,比较野生株,缺失株以及过表达菌株在浮游菌状态下抗氧化应激能力。(6)野生株,缺失株以及过表达菌株分别进行生物膜培养,三天后利用不同浓度过氧化氢分别对形成的生物膜进行刺激, SYTO9/PI染色后荧光显微镜观察,以比较三者间在生物膜状态下抗氧化应激能力。结果:(1)rgsA在铜绿假单胞菌中存在两个转录本,转录本长度分别约为300bp与90bp。其中短片段转录本的转录起始位点,位于NCBI注释基因片段起始下游86bp处,长片段转录本的转录起始位点,位于NCBI注释基因片段起始上游157bp处。(2)经PCR及测序证明,铜绿假单胞菌缺陷株SH2-5中缺失rgsA基因,成功构建铜绿假单胞菌rgsA基因缺陷株。经测序证明,过表达质粒pJN105-SH和补偿/过表达菌株SH2S构建的正确性。(3)生长曲线提示rgsA基因缺陷株生长速度明显低于野生株。(4)经Real-time PCR检测,不同浓度过氧化氢以及有机过氧化物刺激下,RgsA表达均有不同程度的增加,尤其在有机过氧化物刺激时表达明显上升。(5)通过计算生长于含有不同浓度过氧化氢与有机过氧化物的LB平板上的菌落数,以及MTT法检测各实验组中细菌总体活性,rgsA基因缺陷株表现出对过氧化氢及有机过氧化物的抵抗能力明显下降,而在突变菌株中导入表达载体后,在0.1%L-Arabinose的诱导下,对氧化应激的抵抗能力恢复到接近野生株的水平。(6)野生株,缺失株,过表达株在流动培养系统中培养3天后形成生物膜,在30mM过氧化氢刺激下,相比野生株及0.1%L-Arabinose的诱导下的过表达株细菌,缺失株出现大面积能被SYTO9染色的死菌(呈黄色)。结论:rgsA在铜绿假单胞菌中存在两个转录本,证明RgsA在铜绿假单胞菌抗氧化应激中发挥重要作用。
其他文献
大学生的心理具有青年中期的许多特点,但是又不能完全等同社会上的青年.人际交往是大学生健康成长的基本条件,是指大学生个体与群体之间通过一定方式进行互动的过程.在大学生
目的:采用骨生物力学、骨密度测定、microCT和骨组织形态计量学等多种方法综合评价咖啡酸苯乙酯(Caffeic acid phenethyl ester CAPE)对去势骨质疏松小鼠影响的实验研究。方法:取96只12周龄C57BL/6J雌性小鼠随机分为16组,(每组6只)。分别研究CAPE预防骨质疏松部分:1周假手术组(sham PBS组)、去势组(ovx PBS组);4周、7周的sham PB
平民记述的产生来自于民间,传播的渠道也贯穿于民间.平民记述者以记述的形式,围绕其个人成长史、家庭家族史、乡邻村落史以及企业工厂史等追忆撰写成文章,即为传记(回忆录).
封山育林工程的开展是改善林业生态环境,恢复林业植被绿化,保护森林覆盖率的有效措施,其要求实要按照基本的自然规律,以封禁手段为主,规定一定的时间内禁止人为活动进去山区,
当前学前教育得到很高的重视,英语教育低龄化,对幼师的英语能力要求更高.作为培养幼师的主阵地之一的高职院校学前教育专业,其英语教学面对更高挑战.本文通过分析高职学前教