参与马铃薯Y病毒侵染的热激蛋白基因的筛选与功能鉴定

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wjlayt
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
马铃薯(Solanum tuberosum L.)是全球第三大口粮作物,在保证粮食安全、消除贫困、增进人类健康等方面具有重要的作用。但马铃薯在生产中易受50余种病毒的侵害,其中,以马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)危害最为严重,特别是在二次侵染或复合侵染时会导致马铃薯减产超过85%。病毒病无法实施有效的化学防治,加之我国缺乏完善的种薯认证体系,解析病毒的侵染机制,发掘和利用寄主重要感病因子,成为防治病毒病的重要策略之一。热激蛋白是一类分子伴侣家族,种类较多,参与植物生长发育和响应环境胁迫等过程。前人研究表明多个热激蛋白家族的多个成员在多种作物与不同病毒的亲和互作中作为感病基因发挥作用,同时实验室在马铃薯-病毒互作相关基因筛选中也发现部分热激蛋白基因出现明显的差异表达。然而,热激蛋白在马铃薯-病毒互作中的功能及作用机制尚未清楚。本研究系统分析了3个主要的热激蛋白家族基因在马铃薯-PVY互作中的表达模式,并筛选出多个影响PVY侵染的热激蛋白基因,相关结果为解析PVY的侵染机制以及创新病毒防治策略奠定了基础。主要研究结果如下:1.在马铃薯全基因组水平上共鉴定到89个DnaJ基因、20个HSP70基因和7个HSP90基因,并对StDnaJ家族的生物信息进行了系统的分析。StDnaJ家族可以分为4种类型和6个亚家族;在进化上,StDnaJ家族内有8个基因发生了基因重复事件;启动子分析发现,StDnaJ家族拥有丰富的响应逆境和激素的顺式调节元件。这些结果表明了StDnaJ基因家族在进化上以及响应逆境胁迫的多样性。2.以马铃薯感病品种E3和Exploits为研究材料,通过RNA-seq分析发现,StDnaJ17、StDnaJ28、StDnaJ43、StDnaJ72、StHSP70-6、StHSP70-19和StHSP90.5在高温和PVY系统侵染下均呈现显著的上调表达。进一步在本氏烟草中瞬时沉默分析显示,StDnaJ17、StDnaJ72、StHSP70-6和StHSP90.5同源基因沉默后,PVY的侵染受到了明显的抑制,表明这些基因在本烟草中是作为感病基因发挥作用。3.通过稳定遗传转化体系获得了干涉StDnaJ72和StHSP70-6表达的转基因株系。病毒接种实验显示,PVY的侵染在2个干涉转基因株系中均受到了显著地抑制,表明StDnaJ72和StHSP70-6是参与PVY侵染的重要感病因子。4.亚细胞定位显示,StDnaJ72定位于细胞质和细胞核,StHSP70-6定位于细胞核;筛选互作蛋白发现,StDnaJ72与PVY编码的CP和VPg互作,StHSP70-6与PVY编码的NIa、NIb、CP和VPg互作;进一步研究发现StDnaJ72和StHSP70-6也存在直接的互作关系。因此,我们认为StDnaJ72和StHSP70-6作为感病基因的作用机制可能是,StHSP70-6通过招募StDnaJ72进入细胞核,协助其参与对PVY编码的VPg和CP蛋白的折叠、转运或组装等过程,可能还存在其他StDnaJ协助StHSP70-6与NIa和NIb蛋白的互作,最终促进了PVY对马铃薯的系统侵染。5.以干涉StDnaJ72和StHSP70-6的转基因植株为材料,通过RNA-seq分析PVY系统侵染下的差异表达基因,共筛选到56个可能受到StDnaJ72和StHSP70-6共同调控的差异表达基因,其中,BIR基因与油菜素类固醇的代谢相关,2个渗调蛋白与抗逆相关,7个基因与细胞壁主要组分的代谢相关,还有1个韧皮部蛋白可能与病毒的长距离运输有关。这些结果为后续互作机制研究提供了新的思路和潜在的基因资源。
其他文献
材料的物理特性及潜在应用依赖于其结构特征,因而认识和理解结构相变与其物理特性的内在联系对于材料科学领域来说是一个长久不衰的核心科学问题。随着电子信息技术的快速发展,以及新型多铁化合物和异质结构的构建,为材料科学领域的研究开辟了更有前途的领域,并朝着基于钙钛矿结构的研究方向发展。钙钛矿结构氧化物具有在晶体对称性上的广泛适应性以及结合多种阳离子的能力,丰富了材料的物理性质如铁电、铁磁、压电和磁电耦合作
学位
单次多幅超快光学成像(Single-shot Ultrafast Optical Imaging,SUOI)可以在光学光谱范围内以大于108帧/秒(fps)的成像速度实时捕捉瞬态场景,这对于记录不可逆和难以复现的瞬态事件,以及理解物理、化学和生物领域的基本机制是必不可少的。根据获取图像方式的不同,单次多幅超快光学成像技术可以分为两类,一类是直接成像技术,另一类是计算成像技术。直接成像类技术是将瞬态
学位
研究蛋白质-小分子、蛋白质-蛋白质以及蛋白质-核酸相互作用对于理解生理过程、解释疾病和设计新药均具有重要的指导意义。虽然不少实验手段可以为蛋白质与配体之间的相互作用提供一些信息,但实验过程常常需要花费许多人力物力与财力。与此相比,理论计算在计算机能力高速发展的当下,越发地在科学研究领域中显示其优越性。分子动力学模拟、量子化学计算和分子对接等方法已经建立,对蛋白-配体复合物结合细节的预测,已具有一定
学位
胰腺癌是目前最致命的恶性肿瘤之一,5年生存率仅为9%,是全球癌症相关死亡的第七大主要原因。胰腺癌的传统治疗方法包括手术切除、放疗和化疗等,但临床上患者易复发、易耐药。此外,由于胰腺癌的免疫原性较低,现有的免疫检查点阻断剂等免疫治疗效果并不理想,因此亟需寻找新的更有效的治疗策略。重组免疫毒素(recombinant immunotoxin,RIT)是将抗体可变区和细菌外毒素融合表达的重组蛋白,结合了
学位
双孔钾离子K2P通道是一类由KCNK基因家族编码的,具有四次跨膜和两个孔道(4TM/2P)结构的离子通道。在静息状态下,K2P通道能够形成背景电流或漏电流,从而维持细胞的静息膜电位水平,控制细胞兴奋性。K2P通道在神经系统中广泛表达,并参与多种生理病理过程,包括疼痛、抑郁、神经保护、癫痫和局部缺血等。目前关于K2P通道家族公认的门控机制包括C型门控,此外K2P通道还受到胞内结构域的调控影响,电压、
学位
固液界面核心热力学参量及其变化规律的物理本质的获取,对先进金属制造凝固过程控制技术的革新至关重要。由于原子尺度固液界面的实验表征十分困难,近年来研究致力于发展“计算机实验”技术进行探究。然而,现有研究偏重性质计算和测量,对于局域粒子堆积结构,在两相竞争环境下如何受晶格类型、晶面取向、原子间相互作用的共同影响机理认识不够充分,致使本领域一系列科学问题亟待解决:如,界面结构本质(弥散或尖锐)的界定长期
学位
土壤作为自然界的重要组成部分,其各种属性的时空变化对农业生产和生态环境有重要影响。因此,了解其时空分布状况、特征及其影响机制对农作物提质增产和生态环境可持续发展有重要意义。当前的相关研究中,区域尺度的土壤属性时空特征分析主要是基于首尾时间的空间分布数据进行,缺乏对时空连续变异过程的分析,无法完全表达土壤属性的时空变异特征。另外,目前的研究中,普遍缺乏对土壤属性未来分布状况的时空预测。基于以上考虑,
学位
香菇(Lentinula edodus)在我国食用菌产业中具有重要地位,是年产量最高的人工栽培食用菌。香菇料袋或菌棒感染木霉菌(Trichoderma spp.)是导致香菇大幅度减产、产业效益下降的主要因素之一。木霉菌不仅可污染已灭菌的培养料,与香菇菌丝竞争营养和生长空间,还能在香菇菌丝培养、转色和出菇等阶段感染菌丝体而引起菌袋污染或菌棒腐烂。尤其是香菇菌棒受到高温伤害后生长衰弱,更易受到木霉菌感
学位
细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)系统是甘蓝型油菜杂种优势利用的重要途径。利用该系统易于获得全不育群体,降低杂交制种的成本,有利于杂交种在生产上普及应用。从萝卜中发现的Ogu CMS具有不育性稳定、彻底,被成功转育到甘蓝型油菜后,被认为是油菜杂种优势利用最理想的细胞质不育类型。但该类型胞质不育的恢复源仅存在于萝卜中,而直接利用萝卜转育甘蓝型油菜Ogu C
学位
绝大多数的公钥密码方案(包括认证加密方案)依赖于能生成完美随机数的随机数源,以保障方案安全性。然而,错误的算法实现、恶意颠覆以及其他各种原因都会导致随机数源产生不良的随机数。这些情况下的随机数源我们称其为随机数后门攻击下的随机数源。目前已有较多抗随机数后门攻击的方法被提出,典型方法包括对冲公钥密码学(hedged public key cryptography,HPKC)及其变体基于 nonce
学位