【摘 要】
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本文基于粒度计算理论,主要对生物网络的分层结构进行研究,探讨基于模糊邻近关系的结构聚类分析方法及其应用.具体工作如下:在第一章中,简要介绍生物网络及其拓扑性质、国内
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本文基于粒度计算理论,主要对生物网络的分层结构进行研究,探讨基于模糊邻近关系的结构聚类分析方法及其应用.具体工作如下:在第一章中,简要介绍生物网络及其拓扑性质、国内外粒度计算和结构聚类的理论及研究进展、生物网络的分层结构的国内外研究进展,以及本文的主要工作和创新点.在第二章中,基于蛋白质序列的特征向量构定义基于内积的蛋白质序列相似度,通过相似度构建蛋白质网络.基于模糊k均值聚类和完全图提出基于相似度的完全图聚类及算法,用于数据粗粒化的信息提取,利用基于模糊邻近关系的结构聚类方法构建蛋白质网络的分层结构模型.在第三章中,从数据挖掘的角度,应用生物网络的分层结构模型,对H1N1型禽流感病毒数据,提取出数据的内在信息,构建H1N1流感病毒系统进化树,得到病毒变异、进化相关结论.在第四章中,应用生物网络的分层结构模型,结合1902-2013年全球22455条H1N1型禽流感病毒HA蛋白质序列和16444个病毒NA蛋白序列数据进行分析处理,对H1N1病毒重新建模,结合第三章得到的结论,对新模型进行分析.在第五章中,对整个研究工作进行总结,并指出下一步的研究想法和思路.
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