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戊型肝炎病毒(hepatitis E virus, HEV)是一种新现病原微生物,最近才被国际病毒命名委员会(ICTV)归入肝炎病毒科肝炎病毒属。在发展中国家,尤其是在热带和亚热带,HEV是引起急性肝炎暴发流行的主要原因,并且大多是由于饮用被污染的水源所致。人群在感染HEV的同时还可以与其他肝炎病毒发生合并或重叠感染,其中,在慢性HBV感染基础上重叠感染HEV,病情多加重,恢复缓慢,预后较差。孕妇感染HEV后病情表现更为严重,病死率可高达20%。因此由HEV引起的戊型肝炎(HE)是一种严重危害人类健康的传染性疾病。目前尚无HEV疫苗可对人群进行预防接种,对人群总体HEV感染率也缺乏明确的认识,因此,了解全国及各个地区的HEV感染特征对研制和使用HEV疫苗进而达到预防和控制HEV感染就显得十分重要和迫切。临床上诊断HEV感染主要依靠免疫学方法检测HEV抗体,由于抗原抗体反应存在特异性,一种检测试剂质量的高低,关键取决于抗原的选择。刘崇柏等曾于1992年对我国13个省、市、自治区进行过人群HEV流行率的调查,但由于当时采用的Genelabs EIA诊断试剂现已被证实存在较大缺陷,所以结果的准确性受到影响,因此有必要采用新一代的HEV检测试剂重新开展调查。本实验室的卢晶等经过研究和与现有市售试剂比较,证实以HEV不同基因型和亚型p166混合抗原制备的HE免疫诊断试剂具有敏感性高、特异性强、适用面广等特点,是一种可靠的HEV抗体检测试剂。以往的研究表明南方抗-HEV流行率高于北方,其中一个重要原因是,HEV可以通过水源传播。南京市地处长江流域,有丰富的水网分布,人口密集,具备HEV流行的基本条件,而且至今尚无HEV感染状况的报道,因此有必要对南京市人群抗-HEV阳性率做一次大范围的筛查,以期把握HEV的流行状况和流行趋势,为南京市HE的群策群防工作提供事实依据。此外,由于HEV是RNA病毒,核酸复制缺乏校正系统,易于发生变异,基因型特别是基因亚型随着时间的推移会出现新的变化,故存在基因型或基因亚型的多样性,而明确HEV的基因型或亚型对于HE的诊断、预防及流行病学特征具有重要意义。众所周知,运用全基因序列进行基因分型应是分型的金标准,因为它涵盖所有的遗传信息,但是实际操作起来费时费力,可行性不高,所以我们迫切需要选择一段能够代表全基因信息的基因片段来用于HEV基因分型。世界各地的实验室对HEV的基因分型提出了各自不同的区段,总数共达25个之多,其中ORF2 5,末端(nt5994-6294),ORF1 5,末端(nt104-390),ORF2 3,末端(nt6701-7018)最为常用。本实验室的翟理杰等通过生物统计学分析,认为位于ORF1 3,末端(nt4254-4560, MJ-C)能够替代HEV基因组全序列进行基因分型,并建立了新的HEV基因分型标准。基于该前期工作,我们运用此区段来进行南京市HEV基因型的鉴定。因此,本研究实验内容可分为以下两个部分: