中国经济社会发展需要培育一个新的经济增长点，疏通一条新的经济增长通道，敞开一个便捷的对外经济门户，以实践一系列新的经济社会发展科学理论，支撑中国下一个30年的稳步发展，实现GDP科学持续增长，完成国家中长期发展任务。作为最后一个尚未大规模开发的沿海地区，中国西南地区出海门户，广西北部湾经济区是沿海沿江地区实践科学发展观和发展模式的新区域，对其的开发是实践我国区域发展战略在新时期的新阵地。 在深入探析系统动力学理论方法在复杂系统研究领域面临问题的基础上，引入流位变量效应和影响因子等中间变量，运用表函数解析其间数量关系，以相关影响因子为桥梁建立流位方程和流率方程，改进传统系统动力学结构模型，构建广西北部湾经济区经济社会发展系统动力学模型。将该区域经济社会复杂系统分为经济、人口、资源、环境和创新等五大子系统，通过一、二、三产产值、固定资产投资额、外商直接投资额、城镇人口数量、大专及以上人口数量、自然资源、环境污染和创新投入等十个指标描述相关子系统。基于Vensim平台，模拟仿真1990～2050年该区域经济社会主要指标值走势，分析其间的相互影响关系。 在检验所建系统动力学模型结构合理性、历史拟合性和灵敏性的基础上，模拟仿真《广西北部湾经济区发展规划》中提出的服务功能型区域定位、国际化区域合作和集约型发展模式等区域发展政策。通过相关政策实验，分析该区域在加工制造业承接基地、物流中心和会展中心建设，区域开发合作、吸引外资和外资管理，区域发展模式转变、产业规划和环境保护与改善等领域相关政策实施的效果，从系统科学角度提出加强服务功能型区域建设、完善区域开放合作政策和推进集约型发展等可持续发展政策措施。