在真核细胞中,染色质的高次结构处于动态变化的状态:当染色质结构排列紧密时,会阻止初始转录因子和RNA聚合酶募集到相应基因启动子上特定序列的DNA位点,从而使相应基因的转录受到抑制;而当染色质结构疏松时,初始转录因子及RNA聚合酶更易于接近到其基因启动子上,激活相应基因的转录。染色质重塑因子对染色质结构转换起到重要的作用,同时染色质重塑因子在基因转录调控过程中,经由特异的转录因子/特异的DNA序列募集到靶基因上,并作为一个激活或抑制因子而发挥改变染色质结构作用,进而调控相应基因转录的生物学功能。人源INO80染色质重塑酶是ATP酶依赖的染色质重塑复合物属于SWI/SNF2超家族的成员,参与了多种染色质依赖的不同生物学过程。做为染色质重塑酶的一种,h INO80复合物不仅参与基因转录调控、DNA复制和DNA损伤修复等多种重要的生命过程,在小鼠胚胎发育及其干细胞分化过程中也起着重要的作用。在本论文中,我们集中研究h INO80染色质重塑复合物可以影响的下游基因,及其基因间的调控关系网络。其中,h INO80复合物酶活性中心结构域中核心亚基Arp8、Ies2、Ies6和INO80亚基是进化过程中保守的亚基,在其ATP水解酶依赖的核小体在DNA上的滑动中起着重要的作用。本论文主要通过生物芯片和生物信息学方法从转录组水平上研究人源INO80调控的下游基因及其基因间的网络关系,首先通过si RNA干扰的方法敲低h INO80复合物中4个关键保守亚基(Arp8、Ies2、Ies6和INO80催化亚基);然后应用统计学方法和Gene Ontology聚类分析来探索复合物调控的核心通路,包括免疫应答(GO:0051607 defense response to virus)、细胞分化(GO:0045597:positive regulation of cell differentiation)和多糖和脂肪酸代谢(GO:0006027glycosamin-oglycan catabolic process和GO:0006633 fatty acid biosynthetic process)等细胞信号通路;另外我们筛选到了20个h INO80可能直接调控的基因,包括(M160、FAM65B、SIRT4和LAMP2等)。通过以上分析,我们基本阐明了人源INO80染色质重塑酶复合物调控的下游基因及其相关网络结构。