p53蛋白是一个促凋亡的肿瘤抑制因子,由393个氨基酸组成,通常以四聚体的形式存在。作为转录因子,p53直接调节的靶基因有近500个。因此,p53参与了众多的细胞过程,其主要功能是调控细胞凋亡、细胞周期、细胞衰老、新陈代谢和抗氧化等。在没有压力的条件下,p53主要在以Mdm2、Cop I等E3泛素化连接酶为主的负调节因子的作用下维持着较低的水平。当出现癌基因表达、DNA损伤、新陈代谢功能紊乱等压力条件时,细胞会激活一系列调节因子,促进p53的表达并使p53发生磷酸化、乙酰化和甲基化等修饰,从而激活p53的信号通路,使DNA进行修复或者使细胞发生凋亡。然而在很多肿瘤细胞中,p53蛋白发生了突变或者被过度地降解,从而导致p53蛋白的活性无法被激活。天青蛋白是由铜绿假单胞菌分泌的含铜氧化还原蛋白,由128个氨基酸组成。天青蛋白因其能选择性进入多种癌细胞并产生细胞毒性而备受关注。p28是天青蛋白中编号为50～77的氨基酸片段,是引导天青蛋白选择性进入癌细胞并起抗癌作用的主要区域。到目前为止,人们已经提出了多种机制来解释天青蛋白和p28的抗癌活性。其中,通过与肿瘤抑制蛋白p53形成复合物、稳定了p53蛋白是天青蛋白和p28抗癌作用中最重要、也是研究最多的机理。但是,除了分子模拟和分子对接给出的预测性结构之外,目前关于p28/p53复合物结构的信息基本是空白,使得人们无法通过对p28的氨基酸序列进行理性改造来进一步增强p28与p53的相互作用和提高p28的抗癌活性。通过综合利用生物物理学和结构生物学表征手段以及计算机分子模拟,本论文较系统地探索了p28与p53 DNA结合域（DBD）的相互作用。通过丙氨酸突变法、GST pull-down以及表面等离子体共振实验发现L19A突变对p28与p53 DBD的结合影响相对较大。通过荧光偏振实验发现p28在p53 DBD上的结合位置可能与DNA的结合部位有部分的重叠。通过核磁共振波谱初步辨认出p53 DBD中参与p28结合的残基有:Y236、S240、V274、V173、R267、S215、I255、G245、L145、K305、M133、Y103、A161、R156、C277和T211等。最后,通过p53 DBD结合口袋分析以及分子对接,得到了与实验表征结果较吻合的复合物结构模型。