当前我国以水资源为主体媒介的流域存在着水资源生态产品与生态服务价值时空分布不均衡的问题。再加上无序开发流域资源、围湖造田等人为影响,水土流失、水体富营养化等环境问题时有发生,流域生态进一步恶化。生态补偿作为协调各方利益相关者关系、促进流域水资源可持续利用的有效手段,逐步引起社会各界的高度重视。现阶段的生态补偿机制主要以财政转移支付为主,并逐渐由纵向财政转移向横向财政转移转变。流域横向生态补偿机制是促进流域生态保护和水污染外部成本内部化的有效经济政策工具。而确立生态补偿标准是构建生态补偿机制中的关键环节。因此,本文旨在建立一个公平、合理、分类、统一的大流域生态补偿量化标准。本文综合运用文献研究、调研访谈、数理统计等研究方法,通过阅读现有国内外有关流域生态补偿的文献,梳理出可能影响流域生态补偿标准的若干因素,并在此基础上构建流域生态补偿的量化标准。补偿标准主要由流域生态补偿标准的最低限额、上游地区涵养水源引起的保护补偿、上、下游地区竞争引起的水质水量污染赔偿三部分组成。补偿标准最低限额主要取决于生态损害直接成本和生态补偿系数。保护补偿需要核算上游地区水源涵养与保护的总成本（包括实际投入的保护金额和限制经济发展的机会损失）,并按照下游地区享有的水资源服务功能的收益比例进行分摊。污染赔偿需要综合考虑过度利用水资源、超标排放污染物两方面,引入修正因子,根据地方政府的支付能力、支付意愿以及污染事件的特征实行差异化补偿,避免“一刀切”标准的出现。本文通过多元回归检验流域生态补偿量化标准的适用性以及与现实状况的相关性,并通过长江流域的案例分析验证标准的可行性与实践性。本文选取青海省验证上游地区保护补偿标准,研究发现下游各地区因青海省涵养保护水源而享有的收益远远大于其所应分担的治理投入,这种效益—成本分摊机制具有可持续性。本文分别选取四川省、江苏省验证水质、水量补偿标准,测算两地区对下游地区进行污染赔偿的资金分配情况。本文构建的兼顾水质、水量两重标准的分类、统一的大流域生态补偿量化标准以期能为长江流域横向生态补偿机制的完善提供思路。