我国实行着世界上最为严格的耕地保护制度。然而,我国耕地18亿亩红线被逐年逼近,耕地质量逐年下降。原因是我国耕地完全价值核算体系缺位,耕地保护市场经济价值小于其实际价值,农户耕地保护效益流失,耕地经济效益低下,导致农户耕地保护积极性低,耕地数量及质量都没有得到有效的维护。文章通过收益还原法及意愿调查法,核算湖南省耕地的完全价值。以耕地保护流失效益核算为基础建立耕地保护经济补偿机制。通过对湖南省社会经济资料的收集获得湖南省典型地区近三年的耕地种植平均经济收益为23910元/公顷,其中望城县为24705元/公顷；湘潭县为23035元/公顷,耒阳市为22305元/公顷；常德市为25605元/公顷。通过意愿调查法获取湖南省典型地区农户耕地保护受偿意愿,经过收益还原法计算结果替代为耕地保护的非市场价值,最后计算出望城县为131874.24元/公顷,耒阳市为111777.39元/公顷,湘潭县为116283.92元/公顷,常德市为116113.97元/公顷,最终以这种核算方法湖南省其他地区农户耕地保护经济补偿标准。文章构建了耕地保护经济补偿管理体系,认为耕地保护经济补偿的对象是耕地实际经营者,补偿依据是是农户实际经营耕地面积,补偿方式是直接的经济补偿。主要步骤是结合基本农田调查工作,对农户耕地面积进行重新测量,重新颁发承包责任合同书,建立耕地保护数据库,通过计算机计算每个农户应获得的补偿额,通过财政部门进行监督和实施,将耕地保护基金通过银行直接打到农户个人账户。