应用直接测序法对食管癌组织中MT-2A基因突变状况的研究

被引量 : 0次 | 上传用户:xuzhidanxu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:河北省中南部食管癌的发病率居世界之首,食管癌对放疗和化疗均不敏感,因此目前的治疗措施以手术为主。因此,通过各种基础研究,探索食管癌的病因和发病机制,有助于食管癌的早发现、早诊断、早治疗,同时在评估食管癌患者的预后方面,都有着积极的意义。MT是细胞放化疗"解毒"的主要防线,在食管癌中明显高表达,且不同的金属硫蛋白(Metallothineins, MTs)亚型呈现不同的高表达规律。种种迹象表明,这一高表达很可能与基因突变有关,本研究选取食管癌患者,手术获得其肿瘤及正常组织对照,提取DNA,对MT-2A的基因的三个外显子区进行聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction, PCR)扩增,获得相关目的基因的相关基因序列。通过直接测序法得到扩增基因序列,而后将所得结果进行分析,并同人类基因组计划基因比对,寻找有无目的基因突变点存在,以研究MT蛋白编码区是否存在能够导致编码蛋白改变的基因突变。方法:1新鲜食管癌组织和正常食管粘膜组织的获得。收集2010年5月-2011年12月在河北医科大学第四医院胸外科手术的36例食管癌患者的食管癌标本和癌旁正常组织。其中男性24例,女性12例,年龄范围在37-71岁,平均年龄63岁。手术获得新鲜食管癌组织,选取距癌缘5cm以上的食管“正常”粘膜组织作为正常对照。采集组织过程在低温环境下进行,采集后标号并投入液氮保存备用。待术后病理证实为食管鳞状细胞癌的标本入组研究。2将所采集组织切割大小约0.5×0.5×0.5mm的组织制作蜡块。将蜡块切片后行HE染色,确定采集标本为所取组织。3组织DNA提取。切割部分标本行HE染色后,剩余标本采用饱和NaCl法提取组织DNA。将所提取DNA用去离子水溶解,应用分光光度计获得其浓度及纯度-20℃保存备用。4引物设计。应用NCBI查询获得MT-2A外显子区域DNA序列,委托上海生工代为设计引物,经Blast确定引物特异性符合实验要求后合成引物。5目的基因的扩增。根据引物合成报告单推荐退火温度上下浮动2-3℃进行预实验摸索最佳退火温度。根据预实验所得条件进行目的基因的PCR扩增,经琼脂糖凝胶电泳确认扩增效果并判断基因突变可能。6目的基因的直接测序和结果分析。PCR扩增后得到目的基因经琼脂糖凝胶电泳确认后送生工生物工程(上海)有限公司,委托其对扩增产物进行正反链同时测序,在两个序列完全吻合情况下,能够确保100%可靠。最终得到扩增片段的具体序列。而后将所得结果进行分析,并同人类基因组计划基因比对,寻找有无目的基因突变点存在。结果:1所有临床采集标本经HE染色确认,食管癌组织均为食管鳞癌组织,“正常”食管粘膜组织均不含食管癌组织成分。2肿瘤组织与正常组织DNA经PCR后,所得产物电泳后均可出现目的条带,条带单一清晰,位置一致,说明各组织DNA中的引物设计区域无突变存在,上下游引物区间未有插入或缺失基因片段。3经基因测序检测,全部食管癌组织和正常组织标本中均未发现MT-2A的DNA外显子区域存在碱基点突变表现。4发现MT-2A外显子1上游存在一个A/G多态位点,在所有36例患者中,31例不存在该多态位点,5例存在该多态位点,且在癌组织和正常组织中均存在该多态位点。比对人类基因组计划基因库后,证实该多态位点存在。同NCBI数据对比,应用卡方检验分析证实两者无差别(P=0.098)。结论:食管癌患者的食管癌组织中MT-2A的DNA序列呈现出高度保守的现象,即在食管癌组织中未发现能够导致MT-2A编码蛋白改变的DNA突变存在。由此我们认为造成食管癌组织中MT-2A蛋白的蓄积的原因可能是其降解下调造成的,其具体原因有待进一步实验解释。而外显子1的上游区域突变位点对于MT-2A基因的转录、MT-2A蛋白质表达是否有影响,以及其与患者预后之间有无关联仍需进行深入研究。
其他文献
中国经济的发展带来了各类组织的出现和演化,为了更好的适应外在环境的变化,组织结构不断向智能化,柔性化方向发展,同时对员工的重视程度也在不断提高。由于对于组织机制的设计不
产业集聚发展由来已久,由于涉及经济学、管理学等学科,使得国内外学者对其怀有极大的热情,而工业集聚区作为产业集聚的一个领域近几年来也得到了重视。郑州作为中部城市,工业
目的:评价不同缺血心肌再灌注时间对患者TIMI血流、左室重塑、心功能、及长期预后的影响。方法:将本院2010.6-2011.2期间住院的急性ST段抬高型心肌梗死的患者421例,根据再灌注时
社会救助是一项基本的和必要的社会保障工作,也是一项重要的社会安抚工作,它是社会成员保障基本生活的最后一道防线,而地震救助是社会救助中的一个重要组成部分。就我国目前
目的通过调查南京市某企业金属加工液接触者的健康状况,了解相关行业作业人员接触金属加工液情况及其对健康的影响,为及时发现职业健康损害,尽早采取有效措施控制金属加工液
指出了工业化是随时代发展必然诞生的产物,而如何在城市景观中融入工业化,让第一产业和第三产业实现有机结合,就成为重点探讨的话题。针对如何在景观设施设计中应用工业化元
背景和目的变应性鼻炎(allergic rhinitis, AR)是一种由易感个体接触致敏变应原后由IgE抗体参与、以肥大细胞释放介质(主要是组胺等)为开端、有多种免疫活性细胞和细胞因子等
随着高新技术的发展及数以亿计的负荷传感器的产量,使得传统力标准机在性能上已经远远不能适应新的需求。杠杆式力标准机因结构简单、操作方便、力值精度高、成本低等优点,受到
第一部分:血清RAGE对狼疮性肾炎的病理分型与治疗预后的研究目的:通过回顾性检测狼疮性肾炎患者肾穿刺前留取的血、尿标本,探讨血清RAGE在病理分型中的价值。并通过对患者治疗
科学技术不断发展,面对更加多样化的信息技术发展,信息化趋势不断发展,面对众多形式的信息化技术,必须要结合多媒体技术来实现对课堂教学的科学性和高效性控制。信息化时代下