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作为山区农民脱贫致富的主要经济树种,山核桃(Carya cathayensis Sarg.)具有很多困难的问题比如童期较长,不容易采收,树体高大以及园艺化栽培等,这就是山核桃的产业发展上的巨大难题。但是植物嫁接手段是植物的无性繁殖里面比较重要的植物栽培技术,也是解决山核桃优良种质及园艺栽培的重要手段。并且随着嫁接的成熟,人们开始探讨嫁接的机理问题,从而能够更好地指导嫁接。本研究根据基因克隆获得山核桃生长素原初响应基因(CcIAA)片段,采用RACE技术克隆CcIAA基因的cDNA全长,同时进行同源性比对和系统进化树分析,并利用qRT-PCR,Western blot技术分析了在山核桃嫁接过程中CcIAA基因在转录和翻译水平上的表达情况。同时为了探究小RNA在山核桃的嫁接过程里面所起到的功能作用,研究了山核桃嫁的接过程里三个不同阶段(0天,7天和14天)的小RNA测序数据生物信息学分析。主要的研究结果:1克隆获得的CcIAA cDNA从起始的密码子atg,到终止的密码子tga一共含有591个碱基,共编码196个氨基酸。CcIAA与17种树种的17个基因进行同源性比对,发现该基因与其他植物Aux/IAA基因同源性比较高。系统进化树分析同样表明CcIAA与蓖麻RcIAA基因聚为一类,说明它们的亲缘关系最相近,而与其关系比较远的则是鹰嘴豆CaIAA和菜豆PvIAA。2利用qRT-PCR技术,对不同激素处理条件下(如空白的对照,4mg/l IAA和0.3ug/l NPA)不同嫁接时间段(0d,1d,3d,5d,7d和14d)山核桃CcIAA基因的转录表达进行分析。结果说明:对照组里面,山核桃CcIAA基因表达量在砧木和接穗中都是从嫁接前到嫁接后7天都是持续下降的,并且在7天时其表达量几乎为0,但是到14天其表达量会比嫁接前更高。通过IAA处理的山核桃CcIAA基因表达量在嫁接后1天会急剧升高,在随后的4天里,该基因的表达量逐渐下降,然后一直到14天,其表达量都是上升的。砧木和接穗中该基因的表达趋势一致。通过NPA处理,无论是接穗还是砧木,山核桃CcIAA基因表达量明显在嫁接之后7天里都是比较低的,到14天明显升高。用IAA处理过的山核桃CcIAA基因表达量和对照相比是升高的,而用NPA处理过的山核桃CcIAA基因表达量和对照相比也是升高的,但是用IAA处理的表达量表达量则升嫁接前期却没有NPA处理后上升明显。3利用Western blot技术,对不同激素处理条件下(如空白作对照,4mg/l IAA和0.3ug/l NPA)在不同的嫁接时间段(0d,1d,3d,5d,7d和14d)山核桃CcIAA蛋白表达量进行分析。结果表明:CcIAA蛋白在山核桃嫁接的过程中表达量大都是不太相似的。对照中,不管是砧木还是接穗中,CcIAA的蛋白表达量在整个嫁接过程中都是比较低的,并且到14天时表达量明显增加;而用IAA处理后,山核桃CcIAA蛋白表达量明显升高,特别是接穗中的表达量更高;但是用IAA抑制剂NPA处理之后,和对照相比,CcIAA蛋白表达量略有增加,但是和IAA处理对比,发现该蛋白在前期明显受到抑制。4通过对山核桃中三个sRNA文库的测序数据进行生物信息学分析,结果表明21个保守miRNA属于13个miRNA基因家族,但是10个新miRNA和8个潜在的新miRNA属于15个miRNA基因家族。在这些miRNAs中,选取14个miRNAs包含7个保守miRNAs和7个新miRNAs进行表达分析,在山核桃嫁接后7和14天(0天为对照),除了其中三个小RNA cca-miRS4,cca-miRS5和cca-miRS6与Solexa测序表达结果不一致,其余11个miRNAs都显示出与Solexa测序结果具有相同的表达趋势。本实验小RNA测序表达谱中的79%得到验证。另外本研究还预测了保守miRNA基因的89个靶基因和新的miRNA基因的26个靶基因。选取四个miRNA靶基因(cca-miR156,cca-miR159,cca-miR390和cca-miR827)进行qRT-PCR分析,结果表明miRNAs与其相关的靶基因之间是逆表达调控机制。而这一结果也进一步验证了有关miRNAs的Solexa测序结果的可靠性。