纳米科技的发展为微型器件的设计和制备提供了发展的方向及方法。相应仪器技术的出现及发展，为我们对微观世界的观测及操纵提供了强有力的工具。它们以分子为基本构造单元，通过分子与分子或者分子与衬底间的相互作用力生长成为纳米尺度的微结构。有机分子由于其易于制备，多种可变换的官能团，繁多的种类和性质，适宜的分子尺寸在纳米结构的制备中起到了不可替代的作用。 本研究通过分子设计、化学合成、结构表征、自组装/自组织薄膜制备和SPM测试等方法探寻了利用有机分子通过自下而上的方法来制备二维纳米结构。文章总结了有机分子在制备纳米结构中的重要作用，描述了自组装方法和自组织方法；探讨了一种具有自发有序结构的双组分自组织薄膜的制备；利用一种线性烷烃链三取代的卟啉衍生物在HOPG表面构建了二维薄膜；通过叠氮化合物与C60的环加成反应合成了一种新型的C60衍生物，研究了C60Py在Au表面的自组装行为；探索了有机金属串配合物在Au表面上的自组装行为。研究结果为分析Cr5(tpda)4(NCS)2分子的分子电子学性质提供了良好的实验平台。