猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea，PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcineepidemic diarrhea virus，PEDV)引起的一种高度接触性肠道传染病，该病可感染所有年龄的猪群，感染后导致感染猪发生呕吐、水样腹泻和严重脱水，对哺乳仔猪具有极高致死率。为了解猪流行性腹泻病毒在四川规模化猪场的流行情况，本研究对采集于多个规模化猪场的腹泻病例进行猪流行性腹泻病毒的分离、鉴定和分子流行病学研究，取得了以下结果:　　1.猪流行性病毒四川流行株的分离鉴定　　对2012～2014年四川省7个地区的28份PEDV可疑样品进行了RT-PCR检测，其中18份样品为PEDV阳性。将阳性样品处理后接种Vero细胞并连续传代后成功分离出了1株猪流行性腹泻病毒。分离病毒能够中和PEDV阳性血清，中和效价为97.67，使用间接免疫荧光可以检测到分离毒株在Vero细胞中的增殖。对分离毒株进行了病毒理化特性的分析，结果显示该病毒对脂溶剂敏感，而对BUDR不敏感，由此表明所分离毒株为有囊膜的RNA病毒。将分离毒株在Vero细胞中连续传代以观察分离毒株的遗传稳定性，结果表明病毒能在Vero细胞上增殖并具有良好的增殖活性，连续传代后其TCID50均稳定在10-7/mL左右，第40代，病毒TCID50为10-7.28/mL。　　2.PEDV的分子流行病学研究　　将采集的四川省多个规模化养猪场的腹泻病例28份，使用RT-PCR方法检测发现其中有18份为PEDV阳性，阳性率为64.3％。选择不同地区的阳性病例进行PEDV S1基因片段的扩增和序列分析，最后得到18条PEDV四川流行株的S1基因序列。序列分析比较显示18条S1基因相互之间核苷酸同源性为83.9％-99.9％，通过氨基酸序列分析发现，在这18条新测得的氨基酸序列上共观测到68处变异，早期的毒株与本次实验新测得的毒株序列之间的差别主要见于26aa～31aa，57aa～63aa和160aa～167aa位点。选择国内外PEDV的代表毒株与本实验中测定的PEDV S1基因序列构建遗传进化树，结果表明PEDV可分为3个分支(B1-1，B1-2和B2)。本实验中测序的大部分毒株都与韩国分离株一起被划分到B1-1，只有SC14和疫苗株CV777位于B2亚型。