近年来,我国高校办学自主权不断扩大,高校筹集资金的渠道也越来越多。这些因素的变化,使高校的财务结构有了很大的变化。然而,高校的内部管理体制及管理制度却没有及时地跟上。内控制度的不完善与监管的不到位易使高校内部出现贪污舞弊、国有资产流失等现象。武汉大学的腐败案就是最明显的例子。这些的腐败案件的发生不仅给高校造成巨大的资产损失,也对高校的声誉造成严重地影响,使高校在人们心目中的美好形象遭到破坏。促使我们开始研究“象牙塔”内的财务控制问题。高校内部控制制度不健全,有的单位虽建有规章制度,但不落实,不考核,形同虚设,单位经济活动及会计工作本身均处于内部控制无力状态,甚至根本没有建立内部牵制制度。这些高校内部控制的现状都导致了高校内部财务不合规定现象的存在。基于此,本文在参考国外高校内部控制制度,利用相关内部控制理论,结合作者工作经验的基础上,结合我国高等院校内部控制目前尚未形成一个有机联系的完整系统的现状,对我国高校内部控制的现状及存在的问题、原因进行了分析,并尝试设计我国高校内部控制的框架系统,进而提出相应的措施建议。