应用PCR-RFLP方法对云南省26个民族的31个群体,另外还加上一个湖南白族群体,共32个群体的1252个个体进行了Y染色体单倍型多态性分析.共检测12个Y染色体单核苷酸多态位点,发现12种单倍型.根据12种单倍型的频率对32个群体进行主成分分析,并计算遗传距离,构建系统树.最后,结合民族学、语言学以及历史学等学科的相关证据来探讨云南各少数民族间的父系遗传关系以及氐羌、百越和百濮三个古老族群的演化历史.在检测到的12种单倍型中,H5、H6、H8和H11在云南人群中的频率最高,其平均频率分别为17.51％、17.21%、17.76%和13.86%,并且在云南省28个以上的民族群体中均可观察到,这四种单倍型被确定为云南人群的优势单倍型.分布最狭窄且最低频率的单倍型是H13,仅仅出现在六个云南的民族群体中,群平均频率为1.84%.鉴于云南大部分民族群体都是氐羌、百越和百濮三个古老民族部分人群的后裔,对这三个族群的单倍型频率进行了族群间的相互比较发现各个族群各有特点.其中,氐羌族群的少数民族单倍型分布最为丰富,所研究的12种单倍型都可以在这一族群中观察到.而且除H11外,它的H5、H6和H8的单倍型频率均很高.在百越部落中,H11不仅在此次研究中所有的百越后裔少数民族中存在,而且它的频率远远高于其他的单倍型,是百越族群的优势单倍型.H5和H6的频率虽然稍低于H11的频率,但是仍然以较高的频率存在于百越部落中.百濮族群的三个少数民群体单倍型分布相对氐羌和百越比较单一,仅仅观察到六种单倍型,在这六种单倍型中,H8和H11的频率很高,是百濮的优势单倍型,H5和H6也以稍低于H8和H11的频率存在.从主成分分析和聚类分析来看,百濮族群相对于氐羌和百越族群其民族分布最为集中,说明其相互间的亲缘关系最紧密,较为完整的保留了远古祖先的特点.百越族群各民族稍微有些分散,除水族而外,其他三个的亲缘关系较近,他们也较好的保留了远古祖先的一些特点.氐羌族群的民族分布最分散,其中,绝大部分群体与百越族群的亲缘关系较近,小部分与百濮的亲缘关系较近.说明氐羌族群的民族与其他民族发生了更多的交混.这些结果与民族学、语言学等研究得出的结论基本一致.从各个民族单倍型地理分布图可以发现:分布在云南周边地区的民族单倍型种类一般较少,且在部分群体中还会出现一种相对很高或者极高频率的单倍型,这一单倍型的频率不仅远远高于该民族中其他单倍型的频率,甚至在云南人群中都是最高频率.