XRCC3基因多态性、环境与肺癌的关联

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:woshilidefu
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[目的]应用多元统计和数据挖掘技术,探讨肺癌的稳健影响因素及其交互作用;利用HapMap数据库筛选标签SNPs,构建单体型,探讨XRCC3基因多态性与肺癌的关联;采用Meta分析评价XRCC3 Thr241Met多态性与肺癌的关联,探讨国内外有关研究的异质性。[方法]1、采用病例对照研究设计,收集781例肺癌病例与等数的性别、年龄(±3岁)频数匹配的对照,通过调查问卷获取生活饮食习惯等信息。应用Clementine、SPSS、S-PLUS,构建决策树及非条件logistic回归模型,评价吸烟者与不吸烟者各自的肺癌影响因素,计算OR及其95%CI,分析影响因素间的相加交互作用。2、应用分子流行病学研究方法,采集病例的外周血与对照的唾液和口腔细胞,提取DNA,以PCR-RFLP技术对XRCC3的SNPs分型。应用Haploview挑选标签SNPs,LDA检验HWE与LD,SPSS分析最优遗传模型及单个SNP与肺癌的关联,Haplo.stats、THESIAS、PHASE2.1推断单体型频率及其对肺癌的影响。3、计算机检索有关数据库,获取15篇文献,提取其中的16个研究数据信息,结合本研究资料,依据NOS、HWE、匹配状况将研究划分等级,分别采用单变量和多变量方法选择遗传模型,应用Stata评价异质性和发表偏倚、计算效应合并OR值及95%CI,Quanto与SPSS分析各研究的检验效能及分类间的差异。[结果]1、肺癌的危险因素:肺癌家族史(吸烟OR=15.94,95%CI:2.06~123.44;不吸烟OR=3.15,95%CI.1.16~8.57);吸烟包年(OR=4.51,95%CI:3.22~6.32);被动吸烟(轻度OR=2.63,95%CI:1.84~3.75;重度OR=6.25,95%CI:2.30~17.01);居住地污染(吸烟OR=2.26,95%CI:1.37~3.72;不吸烟OR=1.72,95%CI:1.05~2.81)。2、肺癌的保护因素:常吃水果(吸烟OR=0.69,95%CI:0.50~0.96;不吸烟OR=0.44,95%CI:0.32~0.62)。3、吸烟与居住地污染、肺癌家族史存在交互作用。4、XRCC3的rs861537 AG或AA携带者的肺癌风险较GG携带者高(OR=1.51,95%CI:1.19~1.92);携带1个rs1799794 G,肺癌风险降低(OR=0.81,95%CI:0.69~0.95):rs861539多态性与肺癌无明显关联。5、以单体型对CGG/CGG为参照,携带CGG/CAA、CAA/CAA、CAA/CGA均增加了肺癌风险(分别对应OR=1.60,95%CI:1.17~2.19;OR=2.08,95%CI:1.38~3.15:OR=1.66,95%CI:1.10~2.51)。6、迄今为止,在有关rs861539与肺癌关联的研究文献中,欧美的研究存在广泛的遗传模型异质性,我国的研究未见rs861539与肺癌的关联(隐性模型合并OR=1.59,95%CI:0.52~4.87)。[结论]1、吸烟、被动吸烟、肺癌家族史、居住地污染是肺癌的主要危险因素,常吃水果是肺癌的主要保护因素。吸烟与居住地污染、肺癌家族史存在交互作用。2、XRCC3基因多态与肺癌发生有关。3、rs861539与肺癌的关联研究存在异质性,该变异对肺癌无明显遗传效应。
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